RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588315.5

SLC25A39-210, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 2

Gene SLC25A39, Length 1,409 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-210ENST00000588315 STK26Q9P289 416 aa29.25■■■□□ 2.27
SLC25A39-210ENST00000588315 SIRT1Q96EB6 747 aa29.21■■■□□ 2.27
SLC25A39-210ENST00000588315 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
SLC25A39-210ENST00000588315 BRINP3Q76B58 766 aa29.2■■■□□ 2.27
SLC25A39-210ENST00000588315 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.2■■■□□ 2.26
SLC25A39-210ENST00000588315 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.2■■■□□ 2.26
SLC25A39-210ENST00000588315 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.19■■■□□ 2.26
SLC25A39-210ENST00000588315 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.19■■■□□ 2.26
SLC25A39-210ENST00000588315 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.19■■■□□ 2.26
SLC25A39-210ENST00000588315 PHLPP1O60346 1717 aa29.16■■■□□ 2.26
SLC25A39-210ENST00000588315 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.15■■■□□ 2.26
SLC25A39-210ENST00000588315 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
SLC25A39-210ENST00000588315 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
SLC25A39-210ENST00000588315 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.13■■■□□ 2.25
SLC25A39-210ENST00000588315 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
SLC25A39-210ENST00000588315 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
SLC25A39-210ENST00000588315 ILDR2Q71H61 639 aa29.11■■■□□ 2.25
SLC25A39-210ENST00000588315 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.09■■■□□ 2.25
SLC25A39-210ENST00000588315 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.08■■■□□ 2.25
SLC25A39-210ENST00000588315 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
SLC25A39-210ENST00000588315 ORAI2Q96SN7 254 aa29.06■■■□□ 2.24
SLC25A39-210ENST00000588315 ADGRB2O60241 1585 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC25A39-210ENST00000588315 PRAM1Q96QH2 718 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC25A39-210ENST00000588315 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC25A39-210ENST00000588315 JCADQ9P266 1359 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC25A39-210ENST00000588315 POGKQ9P215 609 aa29■■■□□ 2.23
SLC25A39-210ENST00000588315 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SLC25A39-210ENST00000588315 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
SLC25A39-210ENST00000588315 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.98■■■□□ 2.23
SLC25A39-210ENST00000588315 NUTM2FA1L443 756 aa28.97■■■□□ 2.23
SLC25A39-210ENST00000588315 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
SLC25A39-210ENST00000588315 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.95■■■□□ 2.23
SLC25A39-210ENST00000588315 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
SLC25A39-210ENST00000588315 SHPRHQ149N8 1683 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC25A39-210ENST00000588315 LRP6O75581 1613 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC25A39-210ENST00000588315 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC25A39-210ENST00000588315 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
SLC25A39-210ENST00000588315 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.92■■■□□ 2.22
SLC25A39-210ENST00000588315 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
SLC25A39-210ENST00000588315 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.91■■■□□ 2.22
SLC25A39-210ENST00000588315 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.89■■■□□ 2.22
SLC25A39-210ENST00000588315 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
SLC25A39-210ENST00000588315 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.86■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.86■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 FOXO3O43524 673 aa28.86■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.85■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 PXDNQ92626 1479 aa28.84■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 USP47Q96K76 1375 aa28.84■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 USP32Q8NFA0 1604 aa28.83■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.83■■■□□ 2.21
SLC25A39-210ENST00000588315 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.2
SLC25A39-210ENST00000588315 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SLC25A39-210ENST00000588315 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
SLC25A39-210ENST00000588315 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
SLC25A39-210ENST00000588315 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
SLC25A39-210ENST00000588315 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.79■■■□□ 2.2
SLC25A39-210ENST00000588315 ATP7BP35670 1465 aa28.78■■■□□ 2.2
SLC25A39-210ENST00000588315 POTEAQ6S8J7 498 aa28.77■■■□□ 2.2
SLC25A39-210ENST00000588315 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.77■■■□□ 2.2
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF1AQ12756 1690 aa28.77■■■□□ 2.2
SLC25A39-210ENST00000588315 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.74■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 SLC24A1O60721 1099 aa28.74■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 EVC2Q86UK5 1308 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 TESK2Q96S53 571 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 CDK19Q9BWU1 502 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 ITSN1Q15811 1721 aa28.72■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.72■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 SOCS7O14512 581 aa28.71■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.71■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.7■■■□□ 2.19
SLC25A39-210ENST00000588315 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
SLC25A39-210ENST00000588315 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.69■■■□□ 2.18
SLC25A39-210ENST00000588315 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.67■■■□□ 2.18
SLC25A39-210ENST00000588315 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
SLC25A39-210ENST00000588315 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
SLC25A39-210ENST00000588315 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
SLC25A39-210ENST00000588315 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.64■■■□□ 2.18
SLC25A39-210ENST00000588315 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.64■■■□□ 2.18
SLC25A39-210ENST00000588315 ADAMTS2O95450 1211 aa28.63■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 CABP2Q9NPB3 220 aa28.62■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 SBNO1A3KN83 1393 aa28.62■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 PSME1Q06323 249 aa28.61■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 C8orf37Q96NL8 207 aa28.61■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.61■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 AFF2P51816 1311 aa28.61■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.59■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.59■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 TMF1P82094 1093 aa28.59■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
SLC25A39-210ENST00000588315 CDCA8Q53HL2 280 aa28.53■■■□□ 2.16
SLC25A39-210ENST00000588315 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
SLC25A39-210ENST00000588315 NGLY1Q96IV0 654 aa28.53■■■□□ 2.16
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