RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
UBXN6-204ENST00000587324 IFT172Q9UG01 1749 aa28.46■■■□□ 2.15
UBXN6-204ENST00000587324 PXDNQ92626 1479 aa28.46■■■□□ 2.15
UBXN6-204ENST00000587324 ATRNO75882 1429 aa28.44■■■□□ 2.14
UBXN6-204ENST00000587324 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.42■■■□□ 2.14
UBXN6-204ENST00000587324 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
UBXN6-204ENST00000587324 USP21Q9UK80 565 aa28.41■■■□□ 2.14
UBXN6-204ENST00000587324 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.4■■■□□ 2.14
UBXN6-204ENST00000587324 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.38■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.37■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.37■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 TECPR2O15040 1411 aa28.35■■■□□ 2.13
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UBXN6-204ENST00000587324 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.35■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 FOXD1Q16676 465 aa28.35■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.34■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.34■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.33■■■□□ 2.13
UBXN6-204ENST00000587324 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.32■■■□□ 2.12
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UBXN6-204ENST00000587324 FOXO3O43524 673 aa28.29■■■□□ 2.12
UBXN6-204ENST00000587324 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.29■■■□□ 2.12
UBXN6-204ENST00000587324 GLI3P10071 1580 aa28.28■■■□□ 2.12
UBXN6-204ENST00000587324 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
UBXN6-204ENST00000587324 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.27■■■□□ 2.12
UBXN6-204ENST00000587324 KIF1AQ12756 1690 aa28.27■■■□□ 2.12
UBXN6-204ENST00000587324 NUTM2FA1L443 756 aa28.27■■■□□ 2.12
UBXN6-204ENST00000587324 STK26Q9P289 416 aa28.26■■■□□ 2.11
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.26■■■□□ 2.11
UBXN6-204ENST00000587324 PIK3C2GO75747 1445 aa28.26■■■□□ 2.11
UBXN6-204ENST00000587324 USP32Q8NFA0 1604 aa28.25■■■□□ 2.11
UBXN6-204ENST00000587324 ABCC11Q96J66 1382 aa28.24■■■□□ 2.11
UBXN6-204ENST00000587324 SLIT2O94813 1529 aa28.23■■■□□ 2.11
UBXN6-204ENST00000587324 RGL3Q3MIN7 710 aa28.22■■■□□ 2.11
UBXN6-204ENST00000587324 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.22■■■□□ 2.11
UBXN6-204ENST00000587324 ABCA3Q99758 1704 aa28.22■■■□□ 2.11
UBXN6-204ENST00000587324 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.2■■■□□ 2.1
UBXN6-204ENST00000587324 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.2■■■□□ 2.1
UBXN6-204ENST00000587324 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
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UBXN6-204ENST00000587324 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.12■■■□□ 2.09
UBXN6-204ENST00000587324 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.12■■■□□ 2.09
UBXN6-204ENST00000587324 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.12■■■□□ 2.09
UBXN6-204ENST00000587324 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.11■■■□□ 2.09
UBXN6-204ENST00000587324 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.11■■■□□ 2.09
UBXN6-204ENST00000587324 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.11■■■□□ 2.09
UBXN6-204ENST00000587324 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.08■■■□□ 2.09
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC125Q86Z20 511 aa28.07■■■□□ 2.08
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UBXN6-204ENST00000587324 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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UBXN6-204ENST00000587324 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.02■■■□□ 2.08
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UBXN6-204ENST00000587324 DLC1Q96QB1 1528 aa28■■■□□ 2.07
UBXN6-204ENST00000587324 ALS2Q96Q42 1657 aa28■■■□□ 2.07
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UBXN6-204ENST00000587324 ADGRB1O14514 1584 aa27.99■■■□□ 2.07
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UBXN6-204ENST00000587324 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.98■■■□□ 2.07
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UBXN6-204ENST00000587324 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
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UBXN6-204ENST00000587324 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
UBXN6-204ENST00000587324 BTG4Q9NY30 223 aa27.8■■■□□ 2.04
UBXN6-204ENST00000587324 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.8■■■□□ 2.04
UBXN6-204ENST00000587324 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
UBXN6-204ENST00000587324 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
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