RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579572.1

SLC16A3-208, Transcript of solute carrier family 16 member 3, human

TSL 3

Gene SLC16A3, Length 863 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC16A3-208	ENST00000579572	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
SLC16A3-208	ENST00000579572	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
SLC16A3-208	ENST00000579572	STK26	Q9P289	416 aa		29.33	■■■□□ 2.29
SLC16A3-208	ENST00000579572	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		29.32	■■■□□ 2.28
SLC16A3-208	ENST00000579572	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
SLC16A3-208	ENST00000579572	POTEA	Q6S8J7	498 aa		29.3	■■■□□ 2.28
SLC16A3-208	ENST00000579572	LRP6	O75581	1613 aa		29.3	■■■□□ 2.28
SLC16A3-208	ENST00000579572	ORAI2	Q96SN7	254 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SLC16A3-208	ENST00000579572	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SLC16A3-208	ENST00000579572	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SLC16A3-208	ENST00000579572	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SLC16A3-208	ENST00000579572	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		29.26	■■■□□ 2.28
SLC16A3-208	ENST00000579572	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SLC16A3-208	ENST00000579572	DLC1	Q96QB1	1528 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SLC16A3-208	ENST00000579572	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SLC16A3-208	ENST00000579572	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
SLC16A3-208	ENST00000579572	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
SLC16A3-208	ENST00000579572	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
SLC16A3-208	ENST00000579572	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SLC16A3-208	ENST00000579572	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SLC16A3-208	ENST00000579572	ADGRB1	O14514	1584 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SLC16A3-208	ENST00000579572	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SLC16A3-208	ENST00000579572	PRAM1	Q96QH2	718 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SLC16A3-208	ENST00000579572	POGK	Q9P215	609 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SLC16A3-208	ENST00000579572	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	KIF1A	Q12756	1690 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	PXDN	Q92626	1479 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	FOXO3	O43524	673 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	AFF2	P51816	1311 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	RXRB	P28702	533 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	C8orf37	Q96NL8	207 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SLC16A3-208	ENST00000579572	NUTM2F	A1L443	756 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SLC16A3-208	ENST00000579572	ADGRB2	O60241	1585 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SLC16A3-208	ENST00000579572	PSME1	Q06323	249 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SLC16A3-208	ENST00000579572	NGLY1	Q96IV0	654 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SLC16A3-208	ENST00000579572	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SLC16A3-208	ENST00000579572	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SLC16A3-208	ENST00000579572	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
SLC16A3-208	ENST00000579572	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SLC16A3-208	ENST00000579572	ADAMTS2	O95450	1211 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SLC16A3-208	ENST00000579572	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	29.01	■■■□□ 2.23
SLC16A3-208	ENST00000579572	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
SLC16A3-208	ENST00000579572	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
SLC16A3-208	ENST00000579572	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		29	■■■□□ 2.23
SLC16A3-208	ENST00000579572	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
SLC16A3-208	ENST00000579572	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SLC16A3-208	ENST00000579572	SBNO1	A3KN83	1393 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SLC16A3-208	ENST00000579572	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
SLC16A3-208	ENST00000579572	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SLC16A3-208	ENST00000579572	USP21	Q9UK80	565 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SLC16A3-208	ENST00000579572	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SLC16A3-208	ENST00000579572	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SLC16A3-208	ENST00000579572	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SLC16A3-208	ENST00000579572	ARHGEF10	O15013	1369 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SLC16A3-208	ENST00000579572	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SLC16A3-208	ENST00000579572	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SLC16A3-208	ENST00000579572	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SLC16A3-208	ENST00000579572	USP32	Q8NFA0	1604 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SLC16A3-208	ENST00000579572	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SLC16A3-208	ENST00000579572	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SLC16A3-208	ENST00000579572	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SLC16A3-208	ENST00000579572	ATRN	O75882	1429 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SLC16A3-208	ENST00000579572	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SLC16A3-208	ENST00000579572	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
SLC16A3-208	ENST00000579572	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SLC16A3-208	ENST00000579572	RGS12	O14924	1447 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	28.81	■■■□□ 2.2	4e-17	■□□□□ 8.8
SLC16A3-208	ENST00000579572	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	SLIT2	O94813	1529 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	ITSN1	Q15811	1721 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	ATP7B	P35670	1465 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	CDK19	Q9BWU1	502 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SLC16A3-208	ENST00000579572	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SLC16A3-208	ENST00000579572	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SLC16A3-208	ENST00000579572	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SLC16A3-208	ENST00000579572	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SLC16A3-208	ENST00000579572	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SLC16A3-208	ENST00000579572	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SLC16A3-208	ENST00000579572	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SLC16A3-208	ENST00000579572	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SLC16A3-208	ENST00000579572	ALS2	Q96Q42	1657 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SLC16A3-208	ENST00000579572	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC16A3-208	ENST00000579572	VPS72	Q15906	364 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC16A3-208	ENST00000579572	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC16A3-208	ENST00000579572	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SLC16A3-208	ENST00000579572	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SLC16A3-208	ENST00000579572	ABCA3	Q99758	1704 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SLC16A3-208	ENST00000579572	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
SLC16A3-208	ENST00000579572	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		28.64	■■■□□ 2.18

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