RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574236.5

PHF23-208, Transcript of PHD finger protein 23, human

TSL 3

Gene PHF23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF23-208	ENST00000574236	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	34.26	■■■■□ 3.08
PHF23-208	ENST00000574236	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	34.26	■■■■□ 3.07
PHF23-208	ENST00000574236	LAMC1	P11047	1609 aa		34.26	■■■■□ 3.07
PHF23-208	ENST00000574236	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		34.25	■■■■□ 3.07
PHF23-208	ENST00000574236	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		34.24	■■■■□ 3.07
PHF23-208	ENST00000574236	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		34.16	■■■■□ 3.06
PHF23-208	ENST00000574236	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		34.14	■■■■□ 3.06
PHF23-208	ENST00000574236	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	34.14	■■■■□ 3.06
PHF23-208	ENST00000574236	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	34.14	■■■■□ 3.06
PHF23-208	ENST00000574236	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	34.14	■■■■□ 3.06
PHF23-208	ENST00000574236	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	34.14	■■■■□ 3.06
PHF23-208	ENST00000574236	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		34.13	■■■■□ 3.05
PHF23-208	ENST00000574236	ADGRB1	O14514	1584 aa		34.13	■■■■□ 3.05
PHF23-208	ENST00000574236	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	34.12	■■■■□ 3.05
PHF23-208	ENST00000574236	NUTM2F	A1L443	756 aa		34.11	■■■■□ 3.05
PHF23-208	ENST00000574236	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	34.11	■■■■□ 3.05
PHF23-208	ENST00000574236	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		34.11	■■■■□ 3.05
PHF23-208	ENST00000574236	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	34.11	■■■■□ 3.05
PHF23-208	ENST00000574236	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	34.1	■■■■□ 3.05
PHF23-208	ENST00000574236	SIRT1	Q96EB6	747 aa		34.09	■■■■□ 3.05
PHF23-208	ENST00000574236	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		34.08	■■■■□ 3.05
PHF23-208	ENST00000574236	DLC1	Q96QB1	1528 aa		34.05	■■■■□ 3.04
PHF23-208	ENST00000574236	PXDN	Q92626	1479 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PHF23-208	ENST00000574236	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	34.03	■■■■□ 3.04
PHF23-208	ENST00000574236	PRAM1	Q96QH2	718 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PHF23-208	ENST00000574236	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	33.99	■■■■□ 3.03
PHF23-208	ENST00000574236	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.99	■■■■□ 3.03
PHF23-208	ENST00000574236	FOXO3	O43524	673 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PHF23-208	ENST00000574236	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PHF23-208	ENST00000574236	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PHF23-208	ENST00000574236	KIF1A	Q12756	1690 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PHF23-208	ENST00000574236	USP32	Q8NFA0	1604 aa		33.95	■■■■□ 3.03
PHF23-208	ENST00000574236	AFF2	P51816	1311 aa		33.95	■■■■□ 3.03
PHF23-208	ENST00000574236	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.94	■■■■□ 3.02
PHF23-208	ENST00000574236	ADGRB2	O60241	1585 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PHF23-208	ENST00000574236	POGK	Q9P215	609 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PHF23-208	ENST00000574236	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
PHF23-208	ENST00000574236	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.92	■■■■□ 3.02
PHF23-208	ENST00000574236	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PHF23-208	ENST00000574236	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PHF23-208	ENST00000574236	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
PHF23-208	ENST00000574236	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
PHF23-208	ENST00000574236	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PHF23-208	ENST00000574236	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
PHF23-208	ENST00000574236	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PHF23-208	ENST00000574236	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		33.8	■■■■□ 3
PHF23-208	ENST00000574236	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		33.79	■■■■□ 3
PHF23-208	ENST00000574236	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		33.79	■■■■□ 3
PHF23-208	ENST00000574236	NGLY1	Q96IV0	654 aa		33.79	■■■■□ 3
PHF23-208	ENST00000574236	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		33.79	■■■■□ 3
PHF23-208	ENST00000574236	RXRB	P28702	533 aa		33.78	■■■■□ 3
PHF23-208	ENST00000574236	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.77	■■■■□ 3
PHF23-208	ENST00000574236	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		33.76	■■■■□ 3
PHF23-208	ENST00000574236	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PHF23-208	ENST00000574236	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PHF23-208	ENST00000574236	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
PHF23-208	ENST00000574236	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
PHF23-208	ENST00000574236	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
PHF23-208	ENST00000574236	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PHF23-208	ENST00000574236	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
PHF23-208	ENST00000574236	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PHF23-208	ENST00000574236	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.7	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	USP21	Q9UK80	565 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	RGS12	O14924	1447 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	SBNO1	A3KN83	1393 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	PSME1	Q06323	249 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	ATP7B	P35670	1465 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	ITSN1	Q15811	1721 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	ALS2	Q96Q42	1657 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PHF23-208	ENST00000574236	ATRN	O75882	1429 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PHF23-208	ENST00000574236	PLEKHG5	O94827	1062 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PHF23-208	ENST00000574236	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PHF23-208	ENST00000574236	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PHF23-208	ENST00000574236	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PHF23-208	ENST00000574236	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PHF23-208	ENST00000574236	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PHF23-208	ENST00000574236	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PHF23-208	ENST00000574236	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
PHF23-208	ENST00000574236	CDK19	Q9BWU1	502 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PHF23-208	ENST00000574236	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PHF23-208	ENST00000574236	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.56	■■■□□ 2.96
PHF23-208	ENST00000574236	SLIT2	O94813	1529 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PHF23-208	ENST00000574236	ARHGEF10	O15013	1369 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PHF23-208	ENST00000574236	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PHF23-208	ENST00000574236	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PHF23-208	ENST00000574236	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PHF23-208	ENST00000574236	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PHF23-208	ENST00000574236	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
PHF23-208	ENST00000574236	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
PHF23-208	ENST00000574236	GLI3	P10071	1580 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PHF23-208	ENST00000574236	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PHF23-208	ENST00000574236	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PHF23-208	ENST00000574236	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PHF23-208	ENST00000574236	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PHF23-208	ENST00000574236	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94

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