RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572656.2

TRAPPC1-205, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC1, Length 409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-205ENST00000572656 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC1-205ENST00000572656 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC1-205ENST00000572656 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC1-205ENST00000572656 RGL3Q3MIN7 710 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC1-205ENST00000572656 STK26Q9P289 416 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC1-205ENST00000572656 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC1-205ENST00000572656 FOXO3O43524 673 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.77□□□□□ -0.05
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TRAPPC1-205ENST00000572656 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 PXDNQ92626 1479 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 ATRNO75882 1429 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 PPLO60437 1756 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 ABCC11Q96J66 1382 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 NUTM2FA1L443 756 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 SIRT1Q96EB6 747 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 PIK3C2GO75747 1445 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1-205ENST00000572656 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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TRAPPC1-205ENST00000572656 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 CCDC125Q86Z20 511 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 PSME1Q06323 249 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLIT2O94813 1529 aa14.65□□□□□ -0.06
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TRAPPC1-205ENST00000572656 IFT172Q9UG01 1749 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-205ENST00000572656 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-205ENST00000572656 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-205ENST00000572656 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-205ENST00000572656 KIF1AQ12756 1690 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-205ENST00000572656 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-205ENST00000572656 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-205ENST00000572656 PRAM1Q96QH2 718 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-205ENST00000572656 SBNO1A3KN83 1393 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1-205ENST00000572656 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
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TRAPPC1-205ENST00000572656 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAPPC1-205ENST00000572656 USP32Q8NFA0 1604 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAPPC1-205ENST00000572656 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
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TRAPPC1-205ENST00000572656 PLEKHG5O94827 1062 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 EP400Q96L91 3159 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 DLC1Q96QB1 1528 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM83GA6ND36 823 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 ADGRB1O14514 1584 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC1-205ENST00000572656 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC1-205ENST00000572656 ADGRB2O60241 1585 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1-205ENST00000572656 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.51□□□□□ -0.09
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TRAPPC1-205ENST00000572656 MYT1Q01538 1121 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1-205ENST00000572656 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1-205ENST00000572656 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1-205ENST00000572656 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1-205ENST00000572656 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1-205ENST00000572656 ABCA3Q99758 1704 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC1-205ENST00000572656 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
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