RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.12■■■□□ 2.57
NME3-210ENST00000567271 TONSLQ96HA7 1378 aa31.1■■■□□ 2.57
NME3-210ENST00000567271 POGKQ9P215 609 aa31.1■■■□□ 2.57
NME3-210ENST00000567271 BRINP3Q76B58 766 aa31.09■■■□□ 2.57
NME3-210ENST00000567271 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa31.09■■■□□ 2.57
NME3-210ENST00000567271 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP31.07■■■□□ 2.56
NME3-210ENST00000567271 C1orf167Q5SNV9 1468 aa31.07■■■□□ 2.56
NME3-210ENST00000567271 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.03■■■□□ 2.56
NME3-210ENST00000567271 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.02■■■□□ 2.56
NME3-210ENST00000567271 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.99■■■□□ 2.55
NME3-210ENST00000567271 ORAI2Q96SN7 254 aa30.99■■■□□ 2.55
NME3-210ENST00000567271 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
NME3-210ENST00000567271 PHLPP1O60346 1717 aa30.98■■■□□ 2.55
NME3-210ENST00000567271 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
NME3-210ENST00000567271 NUTM2FA1L443 756 aa30.96■■■□□ 2.55
NME3-210ENST00000567271 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
NME3-210ENST00000567271 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.95■■■□□ 2.54
NME3-210ENST00000567271 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
NME3-210ENST00000567271 ADGRB2O60241 1585 aa30.93■■■□□ 2.54
NME3-210ENST00000567271 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.93■■■□□ 2.54
NME3-210ENST00000567271 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
NME3-210ENST00000567271 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
NME3-210ENST00000567271 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
NME3-210ENST00000567271 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
NME3-210ENST00000567271 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.9■■■□□ 2.54
NME3-210ENST00000567271 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.89■■■□□ 2.54
NME3-210ENST00000567271 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
NME3-210ENST00000567271 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.88■■■□□ 2.53
NME3-210ENST00000567271 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
NME3-210ENST00000567271 JCADQ9P266 1359 aa30.86■■■□□ 2.53
NME3-210ENST00000567271 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.85■■■□□ 2.53
NME3-210ENST00000567271 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.84■■■□□ 2.53
NME3-210ENST00000567271 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.82■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 FOXO3O43524 673 aa30.81■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.8■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 USP32Q8NFA0 1604 aa30.8■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.79■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 CDK19Q9BWU1 502 aa30.79■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.79■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.78■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
NME3-210ENST00000567271 KIF1AQ12756 1690 aa30.76■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.75■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.74■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 PXDNQ92626 1479 aa30.74■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 SHPRHQ149N8 1683 aa30.73■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.73■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.72■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 ATP7BP35670 1465 aa30.7■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.7■■■□□ 2.51
NME3-210ENST00000567271 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.69■■■□□ 2.5
NME3-210ENST00000567271 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
NME3-210ENST00000567271 PSME1Q06323 249 aa30.66■■■□□ 2.5
NME3-210ENST00000567271 CABP2Q9NPB3 220 aa30.66■■■□□ 2.5
NME3-210ENST00000567271 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.66■■■□□ 2.5
NME3-210ENST00000567271 EVC2Q86UK5 1308 aa30.65■■■□□ 2.5
NME3-210ENST00000567271 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.63■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 LRP6O75581 1613 aa30.62■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.62■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 ITSN1Q15811 1721 aa30.61■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.6■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.59■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 SBNO1A3KN83 1393 aa30.58■■■□□ 2.49
NME3-210ENST00000567271 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30.56■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.55■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.55■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 ACEP12821 1306 aa30.54■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 USP47Q96K76 1375 aa30.53■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 TESK2Q96S53 571 aa30.52■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 CABP1Q9NZU7 370 aa30.52■■■□□ 2.48
NME3-210ENST00000567271 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
NME3-210ENST00000567271 ARHGEF10O15013 1369 aa30.49■■■□□ 2.47
NME3-210ENST00000567271 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.48■■■□□ 2.47
NME3-210ENST00000567271 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.47■■■□□ 2.47
NME3-210ENST00000567271 SLC24A1O60721 1099 aa30.47■■■□□ 2.47
NME3-210ENST00000567271 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
NME3-210ENST00000567271 ADAMTS2O95450 1211 aa30.46■■■□□ 2.47
NME3-210ENST00000567271 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
NME3-210ENST00000567271 ILDR2Q71H61 639 aa30.43■■■□□ 2.46
NME3-210ENST00000567271 ALS2Q96Q42 1657 aa30.42■■■□□ 2.46
NME3-210ENST00000567271 C8orf37Q96NL8 207 aa30.42■■■□□ 2.46
NME3-210ENST00000567271 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.41■■■□□ 2.46
NME3-210ENST00000567271 POTEAQ6S8J7 498 aa30.38■■■□□ 2.45
NME3-210ENST00000567271 NGLY1Q96IV0 654 aa30.38■■■□□ 2.45
NME3-210ENST00000567271 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms