RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 PIP4K2BP78356 416 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 DCCP43146 1447 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 SLAIN2Q9P270 581 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-208ENST00000566059 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-208ENST00000566059 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SPNS1-208ENST00000566059 MST1RQ04912 1400 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-208ENST00000566059 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-208ENST00000566059 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS1-208ENST00000566059 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
SPNS1-208ENST00000566059 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SPNS1-208ENST00000566059 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-208ENST00000566059 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRB2O60241 1585 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-208ENST00000566059 NUTM2FA1L443 756 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-208ENST00000566059 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SPNS1-208ENST00000566059 BRINP3Q76B58 766 aa25.39■■□□□ 1.66
SPNS1-208ENST00000566059 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.39■■□□□ 1.65
SPNS1-208ENST00000566059 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-208ENST00000566059 ORAI2Q96SN7 254 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-208ENST00000566059 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.36■■□□□ 1.65
SPNS1-208ENST00000566059 HSPA1LP34931 641 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-208ENST00000566059 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-208ENST00000566059 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-208ENST00000566059 CDK19Q9BWU1 502 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-208ENST00000566059 USP47Q96K76 1375 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-208ENST00000566059 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-208ENST00000566059 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-208ENST00000566059 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-208ENST00000566059 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-208ENST00000566059 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-208ENST00000566059 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-208ENST00000566059 USP32Q8NFA0 1604 aa25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-208ENST00000566059 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 EVC2Q86UK5 1308 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 TESK2Q96S53 571 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 CABP2Q9NPB3 220 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 ATP7BP35670 1465 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 FOXO3O43524 673 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 PHLPP1O60346 1717 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-208ENST00000566059 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-208ENST00000566059 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-208ENST00000566059 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-208ENST00000566059 KIF1AQ12756 1690 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-208ENST00000566059 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-208ENST00000566059 SLC24A1O60721 1099 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-208ENST00000566059 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-208ENST00000566059 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-208ENST00000566059 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 PXDNQ92626 1479 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 CABP1Q9NZU7 370 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 ITSN1Q15811 1721 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 TMF1P82094 1093 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 PSME1Q06323 249 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 ACEP12821 1306 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 JCADQ9P266 1359 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-208ENST00000566059 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-208ENST00000566059 SBNO1A3KN83 1393 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-208ENST00000566059 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-208ENST00000566059 TMC1Q8TDI8 760 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-208ENST00000566059 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-208ENST00000566059 CDCA8Q53HL2 280 aa25.02■■□□□ 1.6
SPNS1-208ENST00000566059 SHPRHQ149N8 1683 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 TNS3Q68CZ2 1445 aa25■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 USP6P35125 1406 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGEF10O15013 1369 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-208ENST00000566059 SSH2Q76I76 1423 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-208ENST00000566059 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-208ENST00000566059 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-208ENST00000566059 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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