RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.11■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 PRAM1Q96QH2 718 aa23.09■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 NEUROD1Q13562 356 aa23.08■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.08■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.08■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 ADGRB1O14514 1584 aa23.06■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.06■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.06■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.05■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.05■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.04■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.03■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 ORAI2Q96SN7 254 aa23.02■■□□□ 1.28
RNPS1-208ENST00000563857 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
RNPS1-208ENST00000563857 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23■■□□□ 1.27
RNPS1-208ENST00000563857 TONSLQ96HA7 1378 aa22.99■■□□□ 1.27
RNPS1-208ENST00000563857 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RNPS1-208ENST00000563857 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.98■■□□□ 1.27
RNPS1-208ENST00000563857 PSME1Q06323 249 aa22.96■■□□□ 1.27
RNPS1-208ENST00000563857 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RNPS1-208ENST00000563857 SHPRHQ149N8 1683 aa22.95■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.95■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 ADGRB2O60241 1585 aa22.94■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 NUTM2FA1L443 756 aa22.94■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.94■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 FOXO3O43524 673 aa22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 KIF1AQ12756 1690 aa22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.92■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
RNPS1-208ENST00000563857 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.89■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.89■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.89■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.87■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.86■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.86■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 CDK19Q9BWU1 502 aa22.84■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 PXDNQ92626 1479 aa22.83■■□□□ 1.25
RNPS1-208ENST00000563857 SBNO1A3KN83 1393 aa22.82■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 SLC24A1O60721 1099 aa22.82■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.82■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.81■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.81■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGEF10O15013 1369 aa22.8■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.8■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 EVC2Q86UK5 1308 aa22.8■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.79■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.77■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 LRP6O75581 1613 aa22.77■■□□□ 1.24
RNPS1-208ENST00000563857 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 NGLY1Q96IV0 654 aa22.76■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 ITSN1Q15811 1721 aa22.76■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.76■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.75■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.75■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.74■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 C8orf37Q96NL8 207 aa22.74■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 USP32Q8NFA0 1604 aa22.74■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 ADAMTS2O95450 1211 aa22.73■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.73■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 ATP7BP35670 1465 aa22.73■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 AFF2P51816 1311 aa22.72■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RNPS1-208ENST00000563857 POTEAQ6S8J7 498 aa22.7■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.7■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.7■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 RXRBP28702 533 aa22.68■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 ACEP12821 1306 aa22.67■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 CABP2Q9NPB3 220 aa22.67■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.66■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 USP21Q9UK80 565 aa22.66■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.65■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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