RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3C2B	O00750	1634 aa		23.91	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	PDE3A	Q14432	1141 aa		23.91	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	WWC1	Q8IX03	1113 aa		23.91	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	BCL11A	Q9H165	835 aa		23.91	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	23.9	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	EVC2	Q86UK5	1308 aa		23.9	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		23.9	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	RUNDC1	Q96C34	613 aa		23.9	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	NSD2	O96028	1365 aa		23.9	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		23.89	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	SHPRH	Q149N8	1683 aa		23.89	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	GLI2	P10070	1586 aa		23.89	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP53	Q96M91	514 aa		23.89	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	BCAR3	O75815	825 aa		23.87	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	FAM161A	Q3B820	660 aa		23.87	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	23.87	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		23.86	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		23.86	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	ZFYVE9	O95405	1425 aa		23.85	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		23.85	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	SKAP1	Q86WV1	359 aa		23.84	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	WDR63	Q8IWG1	891 aa		23.84	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		23.84	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	23.84	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		23.83	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	23.83	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	USP35	Q9P2H5	1018 aa		23.83	■■□□□ 1.41
RRN3-205	ENST00000563559	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		23.83	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	AAMP	Q13685	434 aa		23.83	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC27	Q2M243	656 aa		23.83	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		23.83	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	23.82	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	23.82	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	MTHFS	P49914	203 aa		23.81	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		23.81	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	RAPGEF3	O95398	923 aa		23.81	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	23.81	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		23.81	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf34	Q49A92	452 aa		23.78	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		23.77	■■□□□ 1.4
RRN3-205	ENST00000563559	IDI1	Q13907	227 aa		23.75	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	RICTOR	Q6R327	1708 aa		23.75	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	NEUROD2	Q15784	382 aa		23.75	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	23.74	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		23.74	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	23.74	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	RGS3	P49796	1198 aa		23.73	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	23.72	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	23.72	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		23.72	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	CABP2	Q9NPB3	220 aa		23.72	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	ABCC11	Q96J66	1382 aa		23.72	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		23.71	■■□□□ 1.39
RRN3-205	ENST00000563559	NEFM	P07197	916 aa		23.7	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	PANK1	Q8TE04	598 aa		23.7	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	COG6	Q9Y2V7	657 aa		23.7	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	23.7	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	23.69	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	23.69	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		23.69	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	IGHD	P01880	384 aa		23.69	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	23.69	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	23.68	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		23.68	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		23.68	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRB2	O60241	1585 aa		23.67	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PP64	1363 aa		23.67	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		23.67	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	23.67	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	MED14	O60244	1454 aa		23.66	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		23.65	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRM	P28827	1452 aa		23.65	■■□□□ 1.38
RRN3-205	ENST00000563559	STK26	Q9P289	416 aa		23.64	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	23.64	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	ZMYM3	Q14202	1370 aa		23.63	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	23.63	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	23.63	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		23.62	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	23.62	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	POGK	Q9P215	609 aa		23.61	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		23.61	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	PRAM1	Q96QH2	718 aa		23.59	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	23.59	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	23.58	■■□□□ 1.37
RRN3-205	ENST00000563559	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	23.58	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		23.57	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		23.57	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	23.57	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	FYB1	O15117	783 aa		23.57	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	RLBP1	P12271	317 aa		23.57	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	IL16	Q14005	1332 aa		23.57	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	23.56	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		23.56	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	23.56	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	23.56	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		23.56	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		23.55	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	23.54	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	ALK	Q9UM73	1620 aa		23.54	■■□□□ 1.36
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP1	Q9C000	1473 aa		23.54	■■□□□ 1.36

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