RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560702.1

MEIS2-220, Transcript of Meis homeobox 2, humanhuman

TSL 5

Gene MEIS2, Length 3,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS2-220ENST00000560702 FBLN1P23142 703 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 PDE3AQ14432 1141 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 RUNDC1Q96C34 613 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 CABP2Q9NPB3 220 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS2-220ENST00000560702 MCM4P33991 863 aa8.58□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 USP19O94966 1318 aa8.58□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.58□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 SOX12O15370 315 aa8.58□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.57□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.57□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.57□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.57□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 ADGRL2O95490 1459 aa8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 ZNF521Q96K83 1311 aa8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 HMOX1P09601 288 aa8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 RIPK4P57078 832 aa8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 SYNJ2O15056 1496 aa8.55□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 PLA2R1Q13018 1463 aa8.55□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.55□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.55□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.55□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.55□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 TRIM27P14373 513 aa8.54□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.54□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.54□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.54□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.54□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 MPNDQ8N594 471 aa8.54□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.54□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 KANK1Q14678 1352 aa8.53□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.53□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.53□□□□□ -1.04
MEIS2-220ENST00000560702 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.52□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.52□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.52□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 CEP170Q5SW79 1584 aa8.51□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 NUTM2FA1L443 756 aa8.51□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 GBP4Q96PP9 640 aa8.51□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.51□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa8.51□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.51□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.51□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.51□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 PLCB2Q00722 1185 aa8.5□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 MCTP1Q6DN14 999 aa8.5□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.5□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 MRE11P49959 708 aa8.5□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 OSCARQ8IYS5 282 aa8.5□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 SHROOM2Q13796 1616 aa8.5□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.5□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 ESPNB1AK53 854 aa8.5□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.49□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.49□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 SSFA2P28290 1259 aa8.49□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.48□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 WDR63Q8IWG1 891 aa8.48□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 RNF214Q8ND24 703 aa8.48□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.48□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 PRKAR2BP31323 418 aa8.48□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 DCTN1Q14203 1278 aa8.48□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.48□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.47□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.47□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 PIK3C2GO75747 1445 aa8.47□□□□□ -1.05
MEIS2-220ENST00000560702 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms