RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 FUT2Q10981 343 aa9.07□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 MSS51Q4VC12 460 aa9.07□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.07□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 BRICD5Q6PL45 260 aa9.06□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 ATP6V1AP38606 617 aa9.05□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.05□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 FECHP22830 423 aa9.04□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 WDR70Q9NW82 654 aa9.04□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.03□□□□□ -0.96
FAM227B-211ENST00000560557 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.02□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 VSIG8P0DPA2 414 aa9.01□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 SKOR1P84550 965 aa9.01□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 ALDH1A1P00352 501 aa9□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 RDH13Q8NBN7 331 aa9□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 GDF11O95390 407 aa8.99□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 OATP04181 439 aa8.99□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 MMP16P51512 607 aa8.99□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 RASSF7Q02833 373 aa8.99□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 WNT7BP56706 349 aa8.97□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
FAM227B-211ENST00000560557 NUTM2FA1L443 756 aa8.96□□□□□ -0.98
FAM227B-211ENST00000560557 XP32Q5T750 250 aa8.96□□□□□ -0.98
FAM227B-211ENST00000560557 ZFP42Q96MM3 310 aa8.96□□□□□ -0.98
FAM227B-211ENST00000560557 GCGRP47871 477 aa8.94□□□□□ -0.98
FAM227B-211ENST00000560557 FCHSD2O94868 740 aa8.93□□□□□ -0.98
FAM227B-211ENST00000560557 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
FAM227B-211ENST00000560557 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.92□□□□□ -0.98
FAM227B-211ENST00000560557 SIAH2O43255 324 aa8.92□□□□□ -0.98
FAM227B-211ENST00000560557 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
FAM227B-211ENST00000560557 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
FAM227B-211ENST00000560557 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.89□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.89□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 SOBPA7XYQ1 873 aa8.88□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.88□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 Q3C1V9 767 aa8.87□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.86□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.86□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.85□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.85□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.85□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 NLRP7Q8WX94 980 aa8.85□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
FAM227B-211ENST00000560557 IGHA1P01876 353 aa8.83□□□□□ -1
FAM227B-211ENST00000560557 SULF1Q8IWU6 871 aa8.83□□□□□ -1
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
FAM227B-211ENST00000560557 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
FAM227B-211ENST00000560557 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
FAM227B-211ENST00000560557 KRT76Q01546 638 aa8.8□□□□□ -1
FAM227B-211ENST00000560557 SCARF1Q14162 830 aa8.8□□□□□ -1
FAM227B-211ENST00000560557 HIC1Q14526 733 aa8.8□□□□□ -1
FAM227B-211ENST00000560557 PPFIA3O75145 1194 aa8.79□□□□□ -1
FAM227B-211ENST00000560557 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.76□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 TIMP2P16035 220 aa8.75□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 IRS1P35568 1242 aa8.75□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 SH3BP2P78314 561 aa8.75□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 FOXK2Q01167 660 aa8.75□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.75□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 PHOX2BQ99453 314 aa8.75□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.75□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 JUNDP17535 347 aa8.74□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 NNTQ13423 1086 aa8.74□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.74□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 MAN1A2O60476 641 aa8.73□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 HLA-CQ95604 372 aa8.73□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.73□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 ADAM23O75077 832 aa8.72□□□□□ -1.01
FAM227B-211ENST00000560557 ADH1CP00326 375 aa8.71□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.71□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 GNPATO15228 680 aa8.7□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 KANK3Q6NY19 840 aa8.7□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.69□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 CD46P15529 392 aa8.69□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 SVOPQ8N4V2 548 aa8.69□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 KDM4AO75164 1064 aa8.68□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 MPNDQ8N594 471 aa8.68□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.68□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.67□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGEF15O94989 841 aa8.67□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 WHAMMQ8TF30 809 aa8.67□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.66□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 GPR37O15354 613 aa8.65□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 CFAP44Q96MT7 982 aa8.65□□□□□ -1.02
FAM227B-211ENST00000560557 LINC01559Q495D7 138 aa8.64□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.64□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms