RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.12■■■□□ 2.41
RABGGTA-214ENST00000560163 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.1■■■□□ 2.41
RABGGTA-214ENST00000560163 PXDNQ92626 1479 aa30.08■■■□□ 2.41
RABGGTA-214ENST00000560163 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.08■■■□□ 2.41
RABGGTA-214ENST00000560163 NAIPQ13075 1403 aa30.07■■■□□ 2.4
RABGGTA-214ENST00000560163 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.07■■■□□ 2.4
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RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC125Q86Z20 511 aa30.06■■■□□ 2.4
RABGGTA-214ENST00000560163 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
RABGGTA-214ENST00000560163 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.05■■■□□ 2.4
RABGGTA-214ENST00000560163 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.05■■■□□ 2.4
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RABGGTA-214ENST00000560163 PPLO60437 1756 aa30.04■■■□□ 2.4
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RABGGTA-214ENST00000560163 FOXO3O43524 673 aa30.01■■■□□ 2.39
RABGGTA-214ENST00000560163 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
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RABGGTA-214ENST00000560163 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
RABGGTA-214ENST00000560163 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
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RABGGTA-214ENST00000560163 TECPR2O15040 1411 aa29.93■■■□□ 2.38
RABGGTA-214ENST00000560163 GLI3P10071 1580 aa29.92■■■□□ 2.38
RABGGTA-214ENST00000560163 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.92■■■□□ 2.38
RABGGTA-214ENST00000560163 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.92■■■□□ 2.38
RABGGTA-214ENST00000560163 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.91■■■□□ 2.38
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
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RABGGTA-214ENST00000560163 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.89■■■□□ 2.38
RABGGTA-214ENST00000560163 NUTM2FA1L443 756 aa29.88■■■□□ 2.37
RABGGTA-214ENST00000560163 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCC11Q96J66 1382 aa29.87■■■□□ 2.37
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RABGGTA-214ENST00000560163 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.85■■■□□ 2.37
RABGGTA-214ENST00000560163 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.84■■■□□ 2.37
RABGGTA-214ENST00000560163 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.83■■■□□ 2.37
RABGGTA-214ENST00000560163 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.82■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.82■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 USP32Q8NFA0 1604 aa29.82■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.81■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.8■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF1AQ12756 1690 aa29.8■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.8■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 IFT172Q9UG01 1749 aa29.79■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.79■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.78■■■□□ 2.36
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RABGGTA-214ENST00000560163 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.77■■■□□ 2.36
RABGGTA-214ENST00000560163 VPS72Q15906 364 aa29.76■■■□□ 2.35
RABGGTA-214ENST00000560163 SIRT1Q96EB6 747 aa29.76■■■□□ 2.35
RABGGTA-214ENST00000560163 PIK3C2GO75747 1445 aa29.75■■■□□ 2.35
RABGGTA-214ENST00000560163 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
RABGGTA-214ENST00000560163 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.72■■■□□ 2.35
RABGGTA-214ENST00000560163 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.72■■■□□ 2.35
RABGGTA-214ENST00000560163 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
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RABGGTA-214ENST00000560163 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.71■■■□□ 2.35
RABGGTA-214ENST00000560163 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.69■■■□□ 2.34
RABGGTA-214ENST00000560163 PSME1Q06323 249 aa29.68■■■□□ 2.34
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RABGGTA-214ENST00000560163 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.66■■■□□ 2.34
RABGGTA-214ENST00000560163 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.66■■■□□ 2.34
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCA3Q99758 1704 aa29.65■■■□□ 2.34
RABGGTA-214ENST00000560163 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
RABGGTA-214ENST00000560163 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
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RABGGTA-214ENST00000560163 ARHGEF10O15013 1369 aa29.61■■■□□ 2.33
RABGGTA-214ENST00000560163 PLEKHG5O94827 1062 aa29.58■■■□□ 2.33
RABGGTA-214ENST00000560163 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.57■■■□□ 2.32
RABGGTA-214ENST00000560163 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
RABGGTA-214ENST00000560163 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.56■■■□□ 2.32
RABGGTA-214ENST00000560163 NRAPQ86VF7 1730 aa29.56■■■□□ 2.32
RABGGTA-214ENST00000560163 PRAM1Q96QH2 718 aa29.55■■■□□ 2.32
RABGGTA-214ENST00000560163 HRCP23327 699 aa29.54■■■□□ 2.32
RABGGTA-214ENST00000560163 BAG6P46379 1132 aa29.54■■■□□ 2.32
RABGGTA-214ENST00000560163 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
RABGGTA-214ENST00000560163 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.53■■■□□ 2.32
RABGGTA-214ENST00000560163 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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RABGGTA-214ENST00000560163 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.52■■■□□ 2.32
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RABGGTA-214ENST00000560163 DLC1Q96QB1 1528 aa29.49■■■□□ 2.31
RABGGTA-214ENST00000560163 ALS2Q96Q42 1657 aa29.48■■■□□ 2.31
RABGGTA-214ENST00000560163 ADGRB2O60241 1585 aa29.47■■■□□ 2.31
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RABGGTA-214ENST00000560163 MYT1Q01538 1121 aa29.46■■■□□ 2.31
RABGGTA-214ENST00000560163 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
RABGGTA-214ENST00000560163 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.45■■■□□ 2.3
RABGGTA-214ENST00000560163 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.45■■■□□ 2.3
RABGGTA-214ENST00000560163 POGKQ9P215 609 aa29.44■■■□□ 2.3
RABGGTA-214ENST00000560163 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.44■■■□□ 2.3
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM182BQ5T319 152 aa29.43■■■□□ 2.3
RABGGTA-214ENST00000560163 DISP2A7MBM2 1401 aa29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-214ENST00000560163 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.42■■■□□ 2.3
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