RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM94Q12767 1356 aa26.29■■□□□ 1.8
USP3-AS1-203ENST00000559737 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
USP3-AS1-203ENST00000559737 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.25■■□□□ 1.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 TESK2Q96S53 571 aa26.25■■□□□ 1.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 C14orf37Q86TY3 774 aa26.23■■□□□ 1.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.22■■□□□ 1.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.22■■□□□ 1.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.22■■□□□ 1.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADGRB2O60241 1585 aa26.18■■□□□ 1.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.17■■□□□ 1.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.16■■□□□ 1.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 MSH6P52701 1360 aa26.14■■□□□ 1.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.14■■□□□ 1.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.13■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 EVC2Q86UK5 1308 aa26.13■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMF1P82094 1093 aa26.13■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDK19Q9BWU1 502 aa26.13■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.1■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUTM2FA1L443 756 aa26.1■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC24A1O60721 1099 aa26.1■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 CERKQ8TCT0 537 aa26.09■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 CABP2Q9NPB3 220 aa26.09■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 DCCP43146 1447 aa26.09■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATF3P18847 181 aa26.08■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
USP3-AS1-203ENST00000559737 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.06■■□□□ 1.76
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP32Q8NFA0 1604 aa26.05■■□□□ 1.76
USP3-AS1-203ENST00000559737 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.04■■□□□ 1.76
USP3-AS1-203ENST00000559737 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.03■■□□□ 1.76
USP3-AS1-203ENST00000559737 MST1RQ04912 1400 aa26.03■■□□□ 1.76
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP7BP35670 1465 aa26.03■■□□□ 1.76
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.02■■□□□ 1.76
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.02■■□□□ 1.76
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDCA8Q53HL2 280 aa26■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.99■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.99■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.99■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC7Q96M83 1385 aa25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLAIN2Q9P270 581 aa25.97■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.96■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 ORAI2Q96SN7 254 aa25.96■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.96■■□□□ 1.75
USP3-AS1-203ENST00000559737 ITSN1Q15811 1721 aa25.95■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.94■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.94■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.93■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOM1O60784 492 aa25.93■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMC1Q8TDI8 760 aa25.93■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 CABP1Q9NZU7 370 aa25.93■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYOM1P52179 1685 aa25.93■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.92■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.91■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.89■■□□□ 1.74
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.88■■□□□ 1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 BRINP3Q76B58 766 aa25.88■■□□□ 1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIP4K2BP78356 416 aa25.86■■□□□ 1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF1AQ12756 1690 aa25.85■■□□□ 1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.85■■□□□ 1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.85■■□□□ 1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.85■■□□□ 1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACEP12821 1306 aa25.85■■□□□ 1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
USP3-AS1-203ENST00000559737 FOXO3O43524 673 aa25.82■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 AKAP12Q02952 1782 aa25.81■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1W2PP64 1363 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.79■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 PANK3Q9H999 370 aa25.79■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.79■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
USP3-AS1-203ENST00000559737 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.76■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSME1Q06323 249 aa25.76■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.76■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP6P35125 1406 aa25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.73■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 PXDNQ92626 1479 aa25.72■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.71■■□□□ 1.71
USP3-AS1-203ENST00000559737 SSH2Q76I76 1423 aa25.7■■□□□ 1.7
USP3-AS1-203ENST00000559737 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.7■■□□□ 1.7
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
USP3-AS1-203ENST00000559737 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
USP3-AS1-203ENST00000559737 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms