RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 LAMC1P11047 1609 aa29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-210ENST00000559586 ORAI2Q96SN7 254 aa29.41■■■□□ 2.3
RABGGTA-210ENST00000559586 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
RABGGTA-210ENST00000559586 RGL3Q3MIN7 710 aa29.4■■■□□ 2.3
RABGGTA-210ENST00000559586 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
RABGGTA-210ENST00000559586 NGLY1Q96IV0 654 aa29.39■■■□□ 2.3
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAMTS2O95450 1211 aa29.34■■■□□ 2.29
RABGGTA-210ENST00000559586 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.34■■■□□ 2.29
RABGGTA-210ENST00000559586 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.33■■■□□ 2.29
RABGGTA-210ENST00000559586 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.31■■■□□ 2.28
RABGGTA-210ENST00000559586 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.31■■■□□ 2.28
RABGGTA-210ENST00000559586 TECPR2O15040 1411 aa29.29■■■□□ 2.28
RABGGTA-210ENST00000559586 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
RABGGTA-210ENST00000559586 ABCC11Q96J66 1382 aa29.27■■■□□ 2.28
RABGGTA-210ENST00000559586 STK26Q9P289 416 aa29.27■■■□□ 2.28
RABGGTA-210ENST00000559586 USP21Q9UK80 565 aa29.27■■■□□ 2.28
RABGGTA-210ENST00000559586 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.27■■■□□ 2.28
RABGGTA-210ENST00000559586 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
RABGGTA-210ENST00000559586 RGS12O14924 1447 aa29.26■■■□□ 2.27
RABGGTA-210ENST00000559586 MYOM2P54296 1465 aa29.25■■■□□ 2.27
RABGGTA-210ENST00000559586 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
RABGGTA-210ENST00000559586 PIK3C2GO75747 1445 aa29.25■■■□□ 2.27
RABGGTA-210ENST00000559586 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
RABGGTA-210ENST00000559586 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
RABGGTA-210ENST00000559586 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.22■■■□□ 2.27
RABGGTA-210ENST00000559586 FOXO3O43524 673 aa29.21■■■□□ 2.27
RABGGTA-210ENST00000559586 SIRT1Q96EB6 747 aa29.21■■■□□ 2.27
RABGGTA-210ENST00000559586 PXDNQ92626 1479 aa29.19■■■□□ 2.26
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.19■■■□□ 2.26
RABGGTA-210ENST00000559586 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
RABGGTA-210ENST00000559586 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.17■■■□□ 2.26
RABGGTA-210ENST00000559586 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.16■■■□□ 2.26
RABGGTA-210ENST00000559586 ATRNO75882 1429 aa29.14■■■□□ 2.26
RABGGTA-210ENST00000559586 NUTM2FA1L443 756 aa29.14■■■□□ 2.26
RABGGTA-210ENST00000559586 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
RABGGTA-210ENST00000559586 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
RABGGTA-210ENST00000559586 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.12■■■□□ 2.25
RABGGTA-210ENST00000559586 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.12■■■□□ 2.25
RABGGTA-210ENST00000559586 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.11■■■□□ 2.25
RABGGTA-210ENST00000559586 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.1■■■□□ 2.25
RABGGTA-210ENST00000559586 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.09■■■□□ 2.25
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF1AQ12756 1690 aa29.09■■■□□ 2.25
RABGGTA-210ENST00000559586 STAC3Q96MF2 364 aa29.08■■■□□ 2.25
RABGGTA-210ENST00000559586 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.08■■■□□ 2.25
RABGGTA-210ENST00000559586 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.08■■■□□ 2.25
RABGGTA-210ENST00000559586 PSME1Q06323 249 aa29.07■■■□□ 2.24
RABGGTA-210ENST00000559586 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.07■■■□□ 2.24
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.06■■■□□ 2.24
RABGGTA-210ENST00000559586 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.05■■■□□ 2.24
RABGGTA-210ENST00000559586 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
RABGGTA-210ENST00000559586 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC125Q86Z20 511 aa29.03■■■□□ 2.24
RABGGTA-210ENST00000559586 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.03■■■□□ 2.24
RABGGTA-210ENST00000559586 ADGRB1O14514 1584 aa29.03■■■□□ 2.24
RABGGTA-210ENST00000559586 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.01■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.99■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 PRAM1Q96QH2 718 aa28.99■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 POGKQ9P215 609 aa28.99■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 NEUROD1Q13562 356 aa28.97■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.96■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 SBNO1A3KN83 1393 aa28.96■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 SLIT2O94813 1529 aa28.95■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 DLC1Q96QB1 1528 aa28.95■■■□□ 2.23
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGEF10O15013 1369 aa28.94■■■□□ 2.22
RABGGTA-210ENST00000559586 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.93■■■□□ 2.22
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.91■■■□□ 2.22
RABGGTA-210ENST00000559586 USP32Q8NFA0 1604 aa28.91■■■□□ 2.22
RABGGTA-210ENST00000559586 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.9■■■□□ 2.22
RABGGTA-210ENST00000559586 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.9■■■□□ 2.22
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
RABGGTA-210ENST00000559586 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.89■■■□□ 2.22
RABGGTA-210ENST00000559586 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
RABGGTA-210ENST00000559586 EP400Q96L91 3159 aa28.88■■■□□ 2.21
RABGGTA-210ENST00000559586 VPS72Q15906 364 aa28.87■■■□□ 2.21
RABGGTA-210ENST00000559586 ADGRB2O60241 1585 aa28.85■■■□□ 2.21
RABGGTA-210ENST00000559586 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.85■■■□□ 2.21
RABGGTA-210ENST00000559586 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.85■■■□□ 2.21
RABGGTA-210ENST00000559586 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.85■■■□□ 2.21
RABGGTA-210ENST00000559586 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.84■■■□□ 2.21
RABGGTA-210ENST00000559586 GLI3P10071 1580 aa28.84■■■□□ 2.21
RABGGTA-210ENST00000559586 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.83■■■□□ 2.21
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.8■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.8■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 PLEKHG5O94827 1062 aa28.79■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.79■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.77■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM83GA6ND36 823 aa28.77■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.77■■■□□ 2.2
RABGGTA-210ENST00000559586 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.75■■■□□ 2.19
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