RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.51■■■□□ 2.32
SEMA4B-211ENST00000559322 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.49■■■□□ 2.31
SEMA4B-211ENST00000559322 CLTCL1P53675 1640 aa29.48■■■□□ 2.31
SEMA4B-211ENST00000559322 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
SEMA4B-211ENST00000559322 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
SEMA4B-211ENST00000559322 HFM1A2PYH4 1435 aa29.45■■■□□ 2.3
SEMA4B-211ENST00000559322 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SEMA4B-211ENST00000559322 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SEMA4B-211ENST00000559322 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SEMA4B-211ENST00000559322 FOXO3O43524 673 aa29.42■■■□□ 2.3
SEMA4B-211ENST00000559322 PXDNQ92626 1479 aa29.42■■■□□ 2.3
SEMA4B-211ENST00000559322 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.41■■■□□ 2.3
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF1BO60333 1816 aa29.41■■■□□ 2.3
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SEMA4B-211ENST00000559322 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.4■■■□□ 2.3
SEMA4B-211ENST00000559322 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SEMA4B-211ENST00000559322 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.39■■■□□ 2.3
SEMA4B-211ENST00000559322 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
SEMA4B-211ENST00000559322 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.36■■■□□ 2.29
SEMA4B-211ENST00000559322 GLI3P10071 1580 aa29.35■■■□□ 2.29
SEMA4B-211ENST00000559322 SLIT2O94813 1529 aa29.33■■■□□ 2.29
SEMA4B-211ENST00000559322 NUTM2FA1L443 756 aa29.32■■■□□ 2.28
SEMA4B-211ENST00000559322 LRP5O75197 1615 aa29.31■■■□□ 2.28
SEMA4B-211ENST00000559322 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.31■■■□□ 2.28
SEMA4B-211ENST00000559322 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.31■■■□□ 2.28
SEMA4B-211ENST00000559322 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SEMA4B-211ENST00000559322 NAIPQ13075 1403 aa29.28■■■□□ 2.28
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
SEMA4B-211ENST00000559322 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.27■■■□□ 2.28
SEMA4B-211ENST00000559322 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.25■■■□□ 2.27
SEMA4B-211ENST00000559322 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
SEMA4B-211ENST00000559322 USP32Q8NFA0 1604 aa29.23■■■□□ 2.27
SEMA4B-211ENST00000559322 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.23■■■□□ 2.27
SEMA4B-211ENST00000559322 VPS72Q15906 364 aa29.22■■■□□ 2.27
SEMA4B-211ENST00000559322 STK26Q9P289 416 aa29.22■■■□□ 2.27
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.21■■■□□ 2.27
SEMA4B-211ENST00000559322 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.21■■■□□ 2.27
SEMA4B-211ENST00000559322 BAG6P46379 1132 aa29.2■■■□□ 2.26
SEMA4B-211ENST00000559322 PPLO60437 1756 aa29.19■■■□□ 2.26
SEMA4B-211ENST00000559322 A0A0G2JS52 829 aa29.19■■■□□ 2.26
SEMA4B-211ENST00000559322 PLEKHG5O94827 1062 aa29.19■■■□□ 2.26
SEMA4B-211ENST00000559322 MYT1Q01538 1121 aa29.19■■■□□ 2.26
SEMA4B-211ENST00000559322 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.19■■■□□ 2.26
SEMA4B-211ENST00000559322 HRCP23327 699 aa29.17■■■□□ 2.26
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF1AQ12756 1690 aa29.17■■■□□ 2.26
SEMA4B-211ENST00000559322 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
SEMA4B-211ENST00000559322 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.14■■■□□ 2.26
SEMA4B-211ENST00000559322 PSME1Q06323 249 aa29.13■■■□□ 2.25
SEMA4B-211ENST00000559322 TECPR2O15040 1411 aa29.12■■■□□ 2.25
SEMA4B-211ENST00000559322 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.12■■■□□ 2.25
SEMA4B-211ENST00000559322 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.12■■■□□ 2.25
SEMA4B-211ENST00000559322 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.11■■■□□ 2.25
SEMA4B-211ENST00000559322 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.11■■■□□ 2.25
SEMA4B-211ENST00000559322 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.11■■■□□ 2.25
SEMA4B-211ENST00000559322 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.11■■■□□ 2.25
SEMA4B-211ENST00000559322 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.11■■■□□ 2.25
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SEMA4B-211ENST00000559322 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.08■■■□□ 2.25
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCC11Q96J66 1382 aa29.08■■■□□ 2.25
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SEMA4B-211ENST00000559322 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
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SEMA4B-211ENST00000559322 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.03■■■□□ 2.24
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGEF10O15013 1369 aa29.03■■■□□ 2.24
SEMA4B-211ENST00000559322 FAM83GA6ND36 823 aa29.03■■■□□ 2.24
SEMA4B-211ENST00000559322 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
SEMA4B-211ENST00000559322 RGL3Q3MIN7 710 aa29.03■■■□□ 2.24
SEMA4B-211ENST00000559322 SBNO1A3KN83 1393 aa29.02■■■□□ 2.24
SEMA4B-211ENST00000559322 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCA3Q99758 1704 aa28.99■■■□□ 2.23
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.99■■■□□ 2.23
SEMA4B-211ENST00000559322 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.98■■■□□ 2.23
SEMA4B-211ENST00000559322 BTG4Q9NY30 223 aa28.98■■■□□ 2.23
SEMA4B-211ENST00000559322 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.97■■■□□ 2.23
SEMA4B-211ENST00000559322 FAM182BQ5T319 152 aa28.96■■■□□ 2.23
SEMA4B-211ENST00000559322 IFT172Q9UG01 1749 aa28.96■■■□□ 2.23
SEMA4B-211ENST00000559322 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
SEMA4B-211ENST00000559322 SIRT1Q96EB6 747 aa28.94■■■□□ 2.22
SEMA4B-211ENST00000559322 PIK3C2GO75747 1445 aa28.93■■■□□ 2.22
SEMA4B-211ENST00000559322 NRAPQ86VF7 1730 aa28.92■■■□□ 2.22
SEMA4B-211ENST00000559322 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.91■■■□□ 2.22
SEMA4B-211ENST00000559322 DISP2A7MBM2 1401 aa28.9■■■□□ 2.22
SEMA4B-211ENST00000559322 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
SEMA4B-211ENST00000559322 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.89■■■□□ 2.22
SEMA4B-211ENST00000559322 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.223e-6■■□□□ 13.6
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SEMA4B-211ENST00000559322 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.87■■■□□ 2.21
SEMA4B-211ENST00000559322 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.87■■■□□ 2.21
SEMA4B-211ENST00000559322 PRAM1Q96QH2 718 aa28.85■■■□□ 2.21
SEMA4B-211ENST00000559322 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
SEMA4B-211ENST00000559322 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
SEMA4B-211ENST00000559322 ADGRB2O60241 1585 aa28.84■■■□□ 2.21
SEMA4B-211ENST00000559322 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.82■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.82■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 TRIM37O94972 964 aa28.81■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.81■■■□□ 2.2
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