RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.83■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 MIER1Q8N108 512 aa23.83■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.83■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.83■■□□□ 1.4
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNA6P17658 529 aa23.82■■□□□ 1.4
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.81■■□□□ 1.4
USP3-AS1-201ENST00000558831 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
USP3-AS1-201ENST00000558831 NWD1Q149M9 1564 aa23.78■■□□□ 1.4
USP3-AS1-201ENST00000558831 EVC2Q86UK5 1308 aa23.78■■□□□ 1.4
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANP32CO43423 234 aa23.75■■□□□ 1.39
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USP3-AS1-201ENST00000558831 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.72■■□□□ 1.39
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USP3-AS1-201ENST00000558831 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRB2O60241 1585 aa23.68■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDK19Q9BWU1 502 aa23.68■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.67■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 PANK3Q9H999 370 aa23.66■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 CABP2Q9NPB3 220 aa23.66■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 C14orf37Q86TY3 774 aa23.65■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMC1Q8TDI8 760 aa23.64■■□□□ 1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.64■■□□□ 1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYOM1P52179 1685 aa23.63■■□□□ 1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.63■■□□□ 1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
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USP3-AS1-201ENST00000558831 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.61■■□□□ 1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM94Q12767 1356 aa23.6■■□□□ 1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.59■■□□□ 1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.58■■□□□ 1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.57■■□□□ 1.36
USP3-AS1-201ENST00000558831 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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USP3-AS1-201ENST00000558831 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.56■■□□□ 1.36
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USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.54■■□□□ 1.36
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP7BP35670 1465 aa23.53■■□□□ 1.36
USP3-AS1-201ENST00000558831 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.53■■□□□ 1.36
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUTM2FA1L443 756 aa23.52■■□□□ 1.36
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USP3-AS1-201ENST00000558831 CABP1Q9NZU7 370 aa23.51■■□□□ 1.35
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.51■■□□□ 1.35
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USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.49■■□□□ 1.35
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USP3-AS1-201ENST00000558831 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-201ENST00000558831 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.46■■□□□ 1.35
USP3-AS1-201ENST00000558831 RALBP1Q15311 655 aa23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.45■■□□□ 1.34
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USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PP64 1363 aa23.44■■□□□ 1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.43■■□□□ 1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.42■■□□□ 1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.4■■□□□ 1.34
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USP3-AS1-201ENST00000558831 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.39■■□□□ 1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACEP12821 1306 aa23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 MST1RQ04912 1400 aa23.39■■□□□ 1.33
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USP3-AS1-201ENST00000558831 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKAP12Q02952 1782 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRS2Q9HD23 443 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC184Q52MB2 194 aa23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ORAI2Q96SN7 254 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF1AQ12756 1690 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLAIN2Q9P270 581 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP6P35125 1406 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 MORC1Q86VD1 984 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 NLRP13Q86W25 1043 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
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