RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATRNO75882 1429 aa20.36■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NGLY1Q96IV0 654 aa20.35■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IFT172Q9UG01 1749 aa20.35■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.34■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.34■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADAMTS2O95450 1211 aa20.33■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.32■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.32■□□□□ 0.84
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 ABCC11Q96J66 1382 aa20.3■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.29■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PIK3C2GO75747 1445 aa20.28■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.27■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.27■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.27■□□□□ 0.84
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.25■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLIT2O94813 1529 aa20.23■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.22■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.21■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FOXO3O43524 673 aa20.21■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SIRT1Q96EB6 747 aa20.21■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-201ENST00000558086 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.2■□□□□ 0.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.2■□□□□ 0.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GLI3P10071 1580 aa20.2■□□□□ 0.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 USP32Q8NFA0 1604 aa20.2■□□□□ 0.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EP400Q96L91 3159 aa20.19■□□□□ 0.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCDC125Q86Z20 511 aa20.19■□□□□ 0.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.16■□□□□ 0.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.16■□□□□ 0.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.14■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RGL3Q3MIN7 710 aa20.14■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.14■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.14■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.14■□□□□ 0.81
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.13■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DLC1Q96QB1 1528 aa20.12■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADGRB2O60241 1585 aa20.12■□□□□ 0.81
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 SBNO1A3KN83 1393 aa20.11■□□□□ 0.81
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.1■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.09■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.09■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.09■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.07■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADGRB1O14514 1584 aa20.07■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 VPS72Q15906 364 aa20.06■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ARHGEF10O15013 1369 aa20.06■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PSME1Q06323 249 aa20.04■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NRAPQ86VF7 1730 aa20.03■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.03■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ALS2Q96Q42 1657 aa20.02■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SEPT12Q8IYM1 358 aa20■□□□□ 0.79
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRAM1Q96QH2 718 aa20■□□□□ 0.79
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa19.99■□□□□ 0.79
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CABLES1Q8TDN4 633 aa19.98■□□□□ 0.79
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LRP5O75197 1615 aa19.98■□□□□ 0.79
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TULP4Q9NRJ4 1543 aa19.97■□□□□ 0.79
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.79
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM83GA6ND36 823 aa19.95■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRR36Q9H6K5 1346 aa19.94■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KRT27Q7Z3Y8 459 aa19.93■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DEFB132Q7Z7B7 95 aa19.93■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa19.92■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.92■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.91■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POGKQ9P215 609 aa19.91■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.91■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 STAC3Q96MF2 364 aa19.9■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.9■□□□□ 0.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DISP2A7MBM2 1401 aa19.89■□□□□ 0.77
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATP7BP35670 1465 aa19.88■□□□□ 0.77
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RGPD1P0DJD0 1748 aa19.88■□□□□ 0.77
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ITSN1Q15811 1721 aa19.88■□□□□ 0.77
TMC3-AS1-201ENST00000558086 WASLO00401 505 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.87■□□□□ 0.77
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