RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	MS4A1	P11836	297 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	ABCC11	Q96J66	1382 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	PIK3R4	Q99570	1358 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	NEFM	P07197	916 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	RAPGEF3	O95398	923 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	MYOM1	P52179	1685 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	TECPR2	O15040	1411 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	EID1	Q9Y6B2	187 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	POGK	Q9P215	609 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	ALK	Q9UM73	1620 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	CPS1	P31327	1500 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	ADGRB2	O60241	1585 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	ADRA2B	P18089	450 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	PPP2R1A	P30153	589 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	MORC1	Q86VD1	984 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	ZMYM3	Q14202	1370 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	IDI1	Q13907	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	TSPOAP1	O95153	1857 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	FKBP8	Q14318	412 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	SLIT1	O75093	1534 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM23-233	ENST00000557667	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667		E9PSI1	815 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	PTPRM	P28827	1452 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF428	Q96B54	188 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	WDR63	Q8IWG1	891 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	PTCH1	Q13635	1447 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	IL16	Q14005	1332 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	ITSN1	Q15811	1721 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	TBX22	Q9Y458	520 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-233	ENST00000557667	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	C14orf37	Q86TY3	774 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	ZBTB22	O15209	634 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	PRAM1	Q96QH2	718 aa		11.02	□□□□□ -0.64
RBM23-233	ENST00000557667	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-233	ENST00000557667	PDE3A	Q14432	1141 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-233	ENST00000557667	CDK19	Q9BWU1	502 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-233	ENST00000557667	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-233	ENST00000557667	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-233	ENST00000557667	C3	P01024	1663 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-233	ENST00000557667	FCHSD2	O94868	740 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-233	ENST00000557667	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		11.01	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms