RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
NEDD1-212ENST00000557478 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.48■■□□□ 1.67
NEDD1-212ENST00000557478 SHPRHQ149N8 1683 aa25.47■■□□□ 1.67
NEDD1-212ENST00000557478 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.46■■□□□ 1.67
NEDD1-212ENST00000557478 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.46■■□□□ 1.67
NEDD1-212ENST00000557478 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.46■■□□□ 1.67
NEDD1-212ENST00000557478 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
NEDD1-212ENST00000557478 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
NEDD1-212ENST00000557478 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.43■■□□□ 1.66
NEDD1-212ENST00000557478 ORAI2Q96SN7 254 aa25.43■■□□□ 1.66
NEDD1-212ENST00000557478 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.42■■□□□ 1.66
NEDD1-212ENST00000557478 DLC1Q96QB1 1528 aa25.42■■□□□ 1.66
NEDD1-212ENST00000557478 POGKQ9P215 609 aa25.41■■□□□ 1.66
NEDD1-212ENST00000557478 PRAM1Q96QH2 718 aa25.38■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.38■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.37■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 ADGRB1O14514 1584 aa25.35■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 LRP6O75581 1613 aa25.34■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 POTEAQ6S8J7 498 aa25.33■■□□□ 1.65
NEDD1-212ENST00000557478 FOXO3O43524 673 aa25.32■■□□□ 1.64
NEDD1-212ENST00000557478 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.32■■□□□ 1.64
NEDD1-212ENST00000557478 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.31■■□□□ 1.64
NEDD1-212ENST00000557478 PSME1Q06323 249 aa25.3■■□□□ 1.64
NEDD1-212ENST00000557478 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.28■■□□□ 1.64
NEDD1-212ENST00000557478 KIF1AQ12756 1690 aa25.27■■□□□ 1.64
NEDD1-212ENST00000557478 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.27■■□□□ 1.64
NEDD1-212ENST00000557478 NUTM2FA1L443 756 aa25.27■■□□□ 1.64
NEDD1-212ENST00000557478 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
NEDD1-212ENST00000557478 PXDNQ92626 1479 aa25.26■■□□□ 1.63
NEDD1-212ENST00000557478 ADGRB2O60241 1585 aa25.26■■□□□ 1.63
NEDD1-212ENST00000557478 AFF2P51816 1311 aa25.24■■□□□ 1.63
NEDD1-212ENST00000557478 C8orf37Q96NL8 207 aa25.24■■□□□ 1.63
NEDD1-212ENST00000557478 RXRBP28702 533 aa25.23■■□□□ 1.63
NEDD1-212ENST00000557478 NGLY1Q96IV0 654 aa25.23■■□□□ 1.63
NEDD1-212ENST00000557478 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NEDD1-212ENST00000557478 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.22■■□□□ 1.63
NEDD1-212ENST00000557478 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.21■■□□□ 1.63
NEDD1-212ENST00000557478 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NEDD1-212ENST00000557478 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.2■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 SBNO1A3KN83 1393 aa25.19■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 ADAMTS2O95450 1211 aa25.19■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGEF10O15013 1369 aa25.18■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.16■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.14■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.14■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
NEDD1-212ENST00000557478 USP21Q9UK80 565 aa25.13■■□□□ 1.61
NEDD1-212ENST00000557478 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
NEDD1-212ENST00000557478 NEUROD1Q13562 356 aa25.09■■□□□ 1.61
NEDD1-212ENST00000557478 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NEDD1-212ENST00000557478 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.09■■□□□ 1.61
NEDD1-212ENST00000557478 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.08■■□□□ 1.61
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
NEDD1-212ENST00000557478 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
NEDD1-212ENST00000557478 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NEDD1-212ENST00000557478 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.07■■□□□ 1.6
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.07■■□□□ 1.6
NEDD1-212ENST00000557478 CDK19Q9BWU1 502 aa25.06■■□□□ 1.6
NEDD1-212ENST00000557478 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.06■■□□□ 1.6
NEDD1-212ENST00000557478 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.05■■□□□ 1.6
NEDD1-212ENST00000557478 USP32Q8NFA0 1604 aa25.04■■□□□ 1.6
NEDD1-212ENST00000557478 ATP7BP35670 1465 aa25.02■■□□□ 1.6
NEDD1-212ENST00000557478 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 ATRNO75882 1429 aa25.01■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 PLEKHG3A1L390 1219 aa25■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 UNC5CLQ8IV45 518 aa25■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 ITSN1Q15811 1721 aa24.98■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.98■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 TONSLQ96HA7 1378 aa24.98■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 EVC2Q86UK5 1308 aa24.96■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 SLIT2O94813 1529 aa24.96■■□□□ 1.59
NEDD1-212ENST00000557478 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NEDD1-212ENST00000557478 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
NEDD1-212ENST00000557478 RGS12O14924 1447 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD1-212ENST00000557478 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.93■■□□□ 1.58
NEDD1-212ENST00000557478 ACEP12821 1306 aa24.92■■□□□ 1.58
NEDD1-212ENST00000557478 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.92■■□□□ 1.58
NEDD1-212ENST00000557478 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.92■■□□□ 1.58
NEDD1-212ENST00000557478 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
NEDD1-212ENST00000557478 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms