RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 AGLP35573 1532 aa29.64■■■□□ 2.34
RCCD1-208ENST00000557266 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.63■■■□□ 2.33
RCCD1-208ENST00000557266 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.62■■■□□ 2.33
RCCD1-208ENST00000557266 PDE4AP27815 886 aa29.62■■■□□ 2.33
RCCD1-208ENST00000557266 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
RCCD1-208ENST00000557266 BACH2Q9BYV9 841 aa29.59■■■□□ 2.33
RCCD1-208ENST00000557266 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.59■■■□□ 2.33
RCCD1-208ENST00000557266 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.58■■■□□ 2.33
RCCD1-208ENST00000557266 MORC1Q86VD1 984 aa29.58■■■□□ 2.33
RCCD1-208ENST00000557266 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 NGEFQ8N5V2 710 aa29.57■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 E9PSI1 815 aa29.56■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.56■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 USP32Q8NFA0 1604 aa29.56■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 SKAP1Q86WV1 359 aa29.56■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 SHPRHQ149N8 1683 aa29.55■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.54■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
RCCD1-208ENST00000557266 IDI1Q13907 227 aa29.51■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 EVC2Q86UK5 1308 aa29.5■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.49■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 WWC1Q8IX03 1113 aa29.48■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 BCAR3O75815 825 aa29.47■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 ZFYVE9O95405 1425 aa29.47■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.47■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.45■■■□□ 2.31
RCCD1-208ENST00000557266 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.45■■■□□ 2.3
RCCD1-208ENST00000557266 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.45■■■□□ 2.3
RCCD1-208ENST00000557266 MTHFSP49914 203 aa29.42■■■□□ 2.3
RCCD1-208ENST00000557266 RUNDC1Q96C34 613 aa29.42■■■□□ 2.3
RCCD1-208ENST00000557266 CABP2Q9NPB3 220 aa29.42■■■□□ 2.3
RCCD1-208ENST00000557266 NSD2O96028 1365 aa29.4■■■□□ 2.3
RCCD1-208ENST00000557266 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.39■■■□□ 2.3
RCCD1-208ENST00000557266 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
RCCD1-208ENST00000557266 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.39■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.38■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.37■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 CFAP53Q96M91 514 aa29.36■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 NBR1Q14596 966 aa29.35■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 NEUROD2Q15784 382 aa29.35■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 STK26Q9P289 416 aa29.35■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 PTPRMP28827 1452 aa29.34■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 A0A1W2PP64 1363 aa29.33■■■□□ 2.29
RCCD1-208ENST00000557266 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.32■■■□□ 2.28
RCCD1-208ENST00000557266 PDE3AQ14432 1141 aa29.32■■■□□ 2.28
RCCD1-208ENST00000557266 ABCC11Q96J66 1382 aa29.31■■■□□ 2.28
RCCD1-208ENST00000557266 MLECQ14165 292 aa29.3■■■□□ 2.28
RCCD1-208ENST00000557266 WDR63Q8IWG1 891 aa29.3■■■□□ 2.28
RCCD1-208ENST00000557266 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC27Q2M243 656 aa29.29■■■□□ 2.28
RCCD1-208ENST00000557266 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
RCCD1-208ENST00000557266 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
RCCD1-208ENST00000557266 PRAM1Q96QH2 718 aa29.26■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 PANK1Q8TE04 598 aa29.24■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.24■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.274e-12■■□□□ 12.7
RCCD1-208ENST00000557266 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 ADGRB2O60241 1585 aa29.24■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 FAM161AQ3B820 660 aa29.23■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 C8orf34Q49A92 452 aa29.23■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.23■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 IGHDP01880 384 aa29.22■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 COG6Q9Y2V7 657 aa29.22■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.22■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 ALKQ9UM73 1620 aa29.21■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.21■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 RGS3P49796 1198 aa29.2■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.2■■■□□ 2.27
RCCD1-208ENST00000557266 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 POGKQ9P215 609 aa29.2■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 NLRP1Q9C000 1473 aa29.19■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.17■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 MED14O60244 1454 aa29.17■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 FYB1O15117 783 aa29.17■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.17■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 DEKP35659 375 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 ZMYM3Q14202 1370 aa29.16■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.15■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.14■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.14■■■□□ 2.26
RCCD1-208ENST00000557266 RLBP1P12271 317 aa29.12■■■□□ 2.25
RCCD1-208ENST00000557266 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.12■■■□□ 2.25
RCCD1-208ENST00000557266 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.12■■■□□ 2.25
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