RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		19.02	■□□□□ 0.64
ABCD4-222	ENST00000555617	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		19.01	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	ORAI2	Q96SN7	254 aa		19	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	PIK3R4	Q99570	1358 aa		19	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		19	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	NOS1	P29475	1434 aa		19	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	PRELP	P51888	382 aa		18.99	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	CASZ1	Q86V15	1759 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	ADGRB2	O60241	1585 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	USP32	Q8NFA0	1604 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ABCD4-222	ENST00000555617	VPS72	Q15906	364 aa		18.95	■□□□□ 0.62
ABCD4-222	ENST00000555617	PXDN	Q92626	1479 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ABCD4-222	ENST00000555617	HSPA6	P17066	643 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ABCD4-222	ENST00000555617	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ABCD4-222	ENST00000555617	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ABCD4-222	ENST00000555617	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A0G2JS52	829 aa		18.89	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	MYT1	Q01538	1121 aa		18.89	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	TRIM37	O94972	964 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	NRAP	Q86VF7	1730 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	PTGER2	P43116	358 aa		18.87	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		18.87	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	SYT17	Q9BSW7	474 aa		18.87	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	EEA1	Q15075	1411 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ABCD4-222	ENST00000555617	APBA3	O96018	575 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	TSPY4	P0CV99	314 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	TSPY10	P0CW01	314 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	TNS4	Q8IZW8	715 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	DLC1	Q96QB1	1528 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	ADGRL2	O95490	1459 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	NBPF14	Q5TI25	921 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	ABCA3	Q99758	1704 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	ZBTB7A	O95365	584 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	MET	P08581	1390 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	CEP162	Q5TB80	1403 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM83G	A6ND36	823 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ABCD4-222	ENST00000555617	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
ABCD4-222	ENST00000555617	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ABCD4-222	ENST00000555617	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	18.72	■□□□□ 0.59
ABCD4-222	ENST00000555617	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		18.72	■□□□□ 0.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
ABCD4-222	ENST00000555617	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		18.71	■□□□□ 0.59
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP10D	Q9P241	1426 aa		18.71	■□□□□ 0.59
ABCD4-222	ENST00000555617	PCNT	O95613	3336 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	FOXO3	O43524	673 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	KIF15	Q9NS87	1388 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	PLEKHG5	O94827	1062 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	KANK1	Q14678	1352 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	GPR162	Q16538	588 aa		18.65	■□□□□ 0.58
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		18.64	■□□□□ 0.57
ABCD4-222	ENST00000555617	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		18.63	■□□□□ 0.57
ABCD4-222	ENST00000555617	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		18.61	■□□□□ 0.57
ABCD4-222	ENST00000555617	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		18.61	■□□□□ 0.57
ABCD4-222	ENST00000555617	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		18.61	■□□□□ 0.57
ABCD4-222	ENST00000555617	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
ABCD4-222	ENST00000555617	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		18.6	■□□□□ 0.57
ABCD4-222	ENST00000555617	MAP3K5	Q99683	1374 aa		18.59	■□□□□ 0.57
ABCD4-222	ENST00000555617	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		18.59	■□□□□ 0.57
ABCD4-222	ENST00000555617	WDR90	Q96KV7	1748 aa		18.58	■□□□□ 0.57
ABCD4-222	ENST00000555617	BTG4	Q9NY30	223 aa		18.57	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	TNS2	Q63HR2	1409 aa		18.57	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	APLP1	P51693	650 aa		18.56	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		18.56	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	ABCC5	O15440	1437 aa		18.56	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	ADCY9	O60503	1353 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	HTRA3	P83110	453 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	JMY	Q8N9B5	988 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	ARX	Q96QS3	562 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ABCD4-222	ENST00000555617	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		18.51	■□□□□ 0.55

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