RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAMTS2O95450 1211 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NGLY1Q96IV0 654 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STK26Q9P289 416 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.83■■■□□ 2.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.82■■■□□ 2.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCC11Q96J66 1382 aa28.82■■■□□ 2.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TECPR2O15040 1411 aa28.81■■■□□ 2.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.8■■■□□ 2.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.79■■■□□ 2.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FOXO3O43524 673 aa28.77■■■□□ 2.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP21Q9UK80 565 aa28.77■■■□□ 2.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIK3C2GO75747 1445 aa28.76■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIRT1Q96EB6 747 aa28.75■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGS12O14924 1447 aa28.74■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUTM2FA1L443 756 aa28.73■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFT172Q9UG01 1749 aa28.72■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.72■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PXDNQ92626 1479 aa28.71■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYOM2P54296 1465 aa28.69■■■□□ 2.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.66■■■□□ 2.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.65■■■□□ 2.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATRNO75882 1429 aa28.63■■■□□ 2.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.62■■■□□ 2.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.62■■■□□ 2.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.61■■■□□ 2.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.6■■■□□ 2.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.59■■■□□ 2.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.58■■■□□ 2.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.58■■■□□ 2.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.58■■■□□ 2.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSME1Q06323 249 aa28.57■■■□□ 2.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRAM1Q96QH2 718 aa28.57■■■□□ 2.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF1AQ12756 1690 aa28.54■■■□□ 2.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POGKQ9P215 609 aa28.54■■■□□ 2.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.52■■■□□ 2.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SBNO1A3KN83 1393 aa28.48■■■□□ 2.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DLC1Q96QB1 1528 aa28.48■■■□□ 2.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.47■■■□□ 2.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC125Q86Z20 511 aa28.47■■■□□ 2.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAC3Q96MF2 364 aa28.47■■■□□ 2.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLIT2O94813 1529 aa28.47■■■□□ 2.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EP400Q96L91 3159 aa28.46■■■□□ 2.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.45■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HRCP23327 699 aa28.44■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.44■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.44■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.44■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.43■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.43■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.43■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGEF10O15013 1369 aa28.42■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRB1O14514 1584 aa28.41■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.4■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP32Q8NFA0 1604 aa28.4■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.38■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHG5O94827 1062 aa28.38■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VPS72Q15906 364 aa28.38■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRB2O60241 1585 aa28.36■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.35■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLI3P10071 1580 aa28.35■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM83GA6ND36 823 aa28.34■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.34■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.32■■■□□ 2.12
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.32■■■□□ 2.12
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.28■■■□□ 2.12
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.26■■■□□ 2.12
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTG4Q9NY30 223 aa28.24■■■□□ 2.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.23■■■□□ 2.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCA3Q99758 1704 aa28.23■■■□□ 2.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.23■■■□□ 2.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.19■■■□□ 2.1
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