RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PRRX1-208ENST00000553786 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.25■■□□□ 1.63
PRRX1-208ENST00000553786 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PRRX1-208ENST00000553786 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.24■■□□□ 1.63
PRRX1-208ENST00000553786 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PRRX1-208ENST00000553786 MYOM2P54296 1465 aa25.22■■□□□ 1.63
PRRX1-208ENST00000553786 ATRNO75882 1429 aa25.21■■□□□ 1.63
PRRX1-208ENST00000553786 PXDNQ92626 1479 aa25.21■■□□□ 1.63
PRRX1-208ENST00000553786 FOXD1Q16676 465 aa25.2■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.2■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.18■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 STK26Q9P289 416 aa25.18■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 FOXO3O43524 673 aa25.17■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 TECPR2O15040 1411 aa25.17■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 NUTM2FA1L443 756 aa25.15■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 RGL3Q3MIN7 710 aa25.15■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.14■■□□□ 1.62
PRRX1-208ENST00000553786 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.14■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.13■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.13■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.13■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 ABCC11Q96J66 1382 aa25.11■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.1■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.09■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 PIK3C2GO75747 1445 aa25.09■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.09■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 IFT172Q9UG01 1749 aa25.09■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PRRX1-208ENST00000553786 EP400Q96L91 3159 aa25.07■■□□□ 1.6
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PRRX1-208ENST00000553786 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PRRX1-208ENST00000553786 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PRRX1-208ENST00000553786 KIF1AQ12756 1690 aa25.06■■□□□ 1.6
PRRX1-208ENST00000553786 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.04■■□□□ 1.6
PRRX1-208ENST00000553786 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.04■■□□□ 1.6
PRRX1-208ENST00000553786 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.04■■□□□ 1.6
PRRX1-208ENST00000553786 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC125Q86Z20 511 aa25.02■■□□□ 1.6
PRRX1-208ENST00000553786 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.02■■□□□ 1.6
PRRX1-208ENST00000553786 SLIT2O94813 1529 aa25.02■■□□□ 1.6
PRRX1-208ENST00000553786 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.01■■□□□ 1.59
PRRX1-208ENST00000553786 USP32Q8NFA0 1604 aa25.01■■□□□ 1.59
PRRX1-208ENST00000553786 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25■■□□□ 1.59
PRRX1-208ENST00000553786 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PRRX1-208ENST00000553786 GLI3P10071 1580 aa24.98■■□□□ 1.59
PRRX1-208ENST00000553786 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.98■■□□□ 1.59
PRRX1-208ENST00000553786 SIRT1Q96EB6 747 aa24.96■■□□□ 1.59
PRRX1-208ENST00000553786 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.96■■□□□ 1.59
PRRX1-208ENST00000553786 PSME1Q06323 249 aa24.94■■□□□ 1.58
PRRX1-208ENST00000553786 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
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PRRX1-208ENST00000553786 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
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PRRX1-208ENST00000553786 SBNO1A3KN83 1393 aa24.9■■□□□ 1.58
PRRX1-208ENST00000553786 ARHGEF10O15013 1369 aa24.9■■□□□ 1.58
PRRX1-208ENST00000553786 VPS72Q15906 364 aa24.89■■□□□ 1.58
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PRRX1-208ENST00000553786 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 ABCA3Q99758 1704 aa24.86■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 POGKQ9P215 609 aa24.86■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.86■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.85■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 DLC1Q96QB1 1528 aa24.85■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.84■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 ADGRB2O60241 1585 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRX1-208ENST00000553786 A0A0G2JS52 829 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRX1-208ENST00000553786 MYT1Q01538 1121 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRX1-208ENST00000553786 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRX1-208ENST00000553786 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PRRX1-208ENST00000553786 FAM83GA6ND36 823 aa24.78■■□□□ 1.56
PRRX1-208ENST00000553786 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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PRRX1-208ENST00000553786 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
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PRRX1-208ENST00000553786 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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PRRX1-208ENST00000553786 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PRRX1-208ENST00000553786 NRAPQ86VF7 1730 aa24.74■■□□□ 1.55
PRRX1-208ENST00000553786 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRX1-208ENST00000553786 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRX1-208ENST00000553786 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PRRX1-208ENST00000553786 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.72■■□□□ 1.55
PRRX1-208ENST00000553786 ALS2Q96Q42 1657 aa24.72■■□□□ 1.55
PRRX1-208ENST00000553786 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PRRX1-208ENST00000553786 BAG6P46379 1132 aa24.7■■□□□ 1.54
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