RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	CLTCL1	P53675	1640 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	ATRN	O75882	1429 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	NAIP	Q13075	1403 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	FOXO3	O43524	673 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	MYOM2	P54296	1465 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	KIF1B	O60333	1816 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	ABCC11	Q96J66	1382 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	SIRT1	Q96EB6	747 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	TECPR2	O15040	1411 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	PXDN	Q92626	1479 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	PSME1	Q06323	249 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	STK26	Q9P289	416 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	RGL3	Q3MIN7	710 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	NUTM2F	A1L443	756 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CS-233	ENST00000552688	SLIT2	O94813	1529 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	VPS72	Q15906	364 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	PIK3C2G	O75747	1445 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	PPL	O60437	1756 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	SBNO1	A3KN83	1393 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	ARHGEF10	O15013	1369 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CS-233	ENST00000552688	KIF1A	Q12756	1690 aa		10.15	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	FAM83G	A6ND36	823 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	BAG6	P46379	1132 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	PRAM1	Q96QH2	718 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	POGK	Q9P215	609 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	GLI3	P10071	1580 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	USP32	Q8NFA0	1604 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688		A0A0G2JS52	829 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	MYT1	Q01538	1121 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	STAC3	Q96MF2	364 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	BTG4	Q9NY30	223 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	DLC1	Q96QB1	1528 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	PLEKHG5	O94827	1062 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-233	ENST00000552688	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	HRC	P23327	699 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	IFT172	Q9UG01	1749 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	LRP5	O75197	1615 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	DISP2	A7MBM2	1401 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-233	ENST00000552688	ADGRB2	O60241	1585 aa		10.04	□□□□□ -0.8

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