RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551690.1

PPP1CC-209, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 3

Gene PPP1CC, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-209	ENST00000551690	NAIP	Q13075	1403 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP1CC-209	ENST00000551690	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP1CC-209	ENST00000551690	MYOM2	P54296	1465 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP1CC-209	ENST00000551690	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP1CC-209	ENST00000551690	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP1CC-209	ENST00000551690	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP1CC-209	ENST00000551690	FOXO3	O43524	673 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP1CC-209	ENST00000551690	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP1CC-209	ENST00000551690	EP400	Q96L91	3159 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PPP1CC-209	ENST00000551690	PXDN	Q92626	1479 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PPP1CC-209	ENST00000551690	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PPP1CC-209	ENST00000551690	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PPP1CC-209	ENST00000551690	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
PPP1CC-209	ENST00000551690	STK26	Q9P289	416 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP1CC-209	ENST00000551690	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP1CC-209	ENST00000551690	FOXD1	Q16676	465 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP1CC-209	ENST00000551690	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP1CC-209	ENST00000551690	PPL	O60437	1756 aa		32.32	■■■□□ 2.77
PPP1CC-209	ENST00000551690	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PPP1CC-209	ENST00000551690	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP1CC-209	ENST00000551690	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PPP1CC-209	ENST00000551690	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PPP1CC-209	ENST00000551690	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PPP1CC-209	ENST00000551690	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PPP1CC-209	ENST00000551690	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PPP1CC-209	ENST00000551690	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PPP1CC-209	ENST00000551690	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PPP1CC-209	ENST00000551690	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP1CC-209	ENST00000551690	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP1CC-209	ENST00000551690	GLI3	P10071	1580 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PPP1CC-209	ENST00000551690	SLIT2	O94813	1529 aa		32.2	■■■□□ 2.74
PPP1CC-209	ENST00000551690	TECPR2	O15040	1411 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CC-209	ENST00000551690	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CC-209	ENST00000551690	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP1CC-209	ENST00000551690	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP1CC-209	ENST00000551690	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PPP1CC-209	ENST00000551690	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP1CC-209	ENST00000551690	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PPP1CC-209	ENST00000551690	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP1CC-209	ENST00000551690	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP1CC-209	ENST00000551690	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CC-209	ENST00000551690	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CC-209	ENST00000551690	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CC-209	ENST00000551690	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PPP1CC-209	ENST00000551690	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP1CC-209	ENST00000551690	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP1CC-209	ENST00000551690	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP1CC-209	ENST00000551690	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PPP1CC-209	ENST00000551690	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	VPS72	Q15906	364 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	PSME1	Q06323	249 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP1CC-209	ENST00000551690	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	SIRT1	Q96EB6	747 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	FAM83G	A6ND36	823 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690		A0A0G2JS52	829 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	MYT1	Q01538	1121 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PPP1CC-209	ENST00000551690	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PPP1CC-209	ENST00000551690	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PPP1CC-209	ENST00000551690	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PPP1CC-209	ENST00000551690	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PPP1CC-209	ENST00000551690	PRAM1	Q96QH2	718 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PPP1CC-209	ENST00000551690	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-209	ENST00000551690	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-209	ENST00000551690	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PPP1CC-209	ENST00000551690	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PPP1CC-209	ENST00000551690	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PPP1CC-209	ENST00000551690	BAG6	P46379	1132 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PPP1CC-209	ENST00000551690	BTG4	Q9NY30	223 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PPP1CC-209	ENST00000551690	POGK	Q9P215	609 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-209	ENST00000551690	LRP5	O75197	1615 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-209	ENST00000551690	FAM182B	Q5T319	152 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PPP1CC-209	ENST00000551690	HRC	P23327	699 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PPP1CC-209	ENST00000551690	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PPP1CC-209	ENST00000551690	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PPP1CC-209	ENST00000551690	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP1CC-209	ENST00000551690	NRAP	Q86VF7	1730 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP1CC-209	ENST00000551690	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PPP1CC-209	ENST00000551690	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PPP1CC-209	ENST00000551690	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PPP1CC-209	ENST00000551690	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PPP1CC-209	ENST00000551690	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PPP1CC-209	ENST00000551690	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP1CC-209	ENST00000551690	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP1CC-209	ENST00000551690	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP1CC-209	ENST00000551690	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms