RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550051.5

TRAFD1-207, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRAFD1, Length 1,003 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-207ENST00000550051 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAFD1-207ENST00000550051 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-207ENST00000550051 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-207ENST00000550051 ADAMTS2O95450 1211 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-207ENST00000550051 HFM1A2PYH4 1435 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-207ENST00000550051 RGS12O14924 1447 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-207ENST00000550051 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAFD1-207ENST00000550051 USP21Q9UK80 565 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAFD1-207ENST00000550051 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAFD1-207ENST00000550051 PPLO60437 1756 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAFD1-207ENST00000550051 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-207ENST00000550051 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAFD1-207ENST00000550051 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 ATRNO75882 1429 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 FOXO3O43524 673 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 CCDC125Q86Z20 511 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 MYOM2P54296 1465 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 PXDNQ92626 1479 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 TECPR2O15040 1411 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 ABCC11Q96J66 1382 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAFD1-207ENST00000550051 SIRT1Q96EB6 747 aa14.78□□□□□ -0.04
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TRAFD1-207ENST00000550051 STK26Q9P289 416 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 RGL3Q3MIN7 710 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 IFT172Q9UG01 1749 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 NUTM2FA1L443 756 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 PIK3C2GO75747 1445 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-207ENST00000550051 SLIT2O94813 1529 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 KIF1AQ12756 1690 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 PSME1Q06323 249 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 EP400Q96L91 3159 aa14.69□□□□□ -0.06
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TRAFD1-207ENST00000550051 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 GLI3P10071 1580 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 VPS72Q15906 364 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 SBNO1A3KN83 1393 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-207ENST00000550051 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.65□□□□□ -0.06
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TRAFD1-207ENST00000550051 USP32Q8NFA0 1604 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-207ENST00000550051 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-207ENST00000550051 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-207ENST00000550051 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-207ENST00000550051 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.63□□□□□ -0.07
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TRAFD1-207ENST00000550051 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-207ENST00000550051 PRAM1Q96QH2 718 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-207ENST00000550051 ARHGEF10O15013 1369 aa14.61□□□□□ -0.07
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TRAFD1-207ENST00000550051 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-207ENST00000550051 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAFD1-207ENST00000550051 DLC1Q96QB1 1528 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAFD1-207ENST00000550051 ABCA3Q99758 1704 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAFD1-207ENST00000550051 STAC3Q96MF2 364 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAFD1-207ENST00000550051 ADGRB2O60241 1585 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAFD1-207ENST00000550051 PLEKHG5O94827 1062 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAFD1-207ENST00000550051 BTG4Q9NY30 223 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAFD1-207ENST00000550051 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAFD1-207ENST00000550051 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAFD1-207ENST00000550051 ADGRB1O14514 1584 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAFD1-207ENST00000550051 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAFD1-207ENST00000550051 ALS2Q96Q42 1657 aa14.53□□□□□ -0.08
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