RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 ADGRL2O95490 1459 aa24.14■■□□□ 1.46
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CLSTN3-216ENST00000545663 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CLSTN3-216ENST00000545663 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CLSTN3-216ENST00000545663 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.09■■□□□ 1.45
CLSTN3-216ENST00000545663 FOXO3O43524 673 aa24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3-216ENST00000545663 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3-216ENST00000545663 SLIT2O94813 1529 aa24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3-216ENST00000545663 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.07■■□□□ 1.44
CLSTN3-216ENST00000545663 PXDNQ92626 1479 aa24.07■■□□□ 1.44
CLSTN3-216ENST00000545663 BAG6P46379 1132 aa24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3-216ENST00000545663 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.06■■□□□ 1.44
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CLSTN3-216ENST00000545663 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
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CLSTN3-216ENST00000545663 VPS72Q15906 364 aa24■■□□□ 1.43
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CLSTN3-216ENST00000545663 PLEKHG5O94827 1062 aa23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3-216ENST00000545663 NUP155O75694 1391 aa23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM182BQ5T319 152 aa23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3-216ENST00000545663 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3-216ENST00000545663 A0A0G2JS52 829 aa23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3-216ENST00000545663 MYT1Q01538 1121 aa23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3-216ENST00000545663 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3-216ENST00000545663 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3-216ENST00000545663 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.92■■□□□ 1.42
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CLSTN3-216ENST00000545663 HFM1A2PYH4 1435 aa23.87■■□□□ 1.41
CLSTN3-216ENST00000545663 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM83GA6ND36 823 aa23.84■■□□□ 1.41
CLSTN3-216ENST00000545663 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.84■■□□□ 1.41
CLSTN3-216ENST00000545663 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.83■■□□□ 1.41
CLSTN3-216ENST00000545663 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.83■■□□□ 1.4
CLSTN3-216ENST00000545663 IFFO2Q5TF58 517 aa23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3-216ENST00000545663 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3-216ENST00000545663 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.81■■□□□ 1.4
CLSTN3-216ENST00000545663 NAIPQ13075 1403 aa23.81■■□□□ 1.4
CLSTN3-216ENST00000545663 CLTCL1P53675 1640 aa23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3-216ENST00000545663 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.79■■□□□ 1.4
CLSTN3-216ENST00000545663 DISP2A7MBM2 1401 aa23.79■■□□□ 1.4
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CLSTN3-216ENST00000545663 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.78■■□□□ 1.4
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CLSTN3-216ENST00000545663 STK26Q9P289 416 aa23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3-216ENST00000545663 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.76■■□□□ 1.39
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CLSTN3-216ENST00000545663 ROCK1Q13464 1354 aa23.74■■□□□ 1.39
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CLSTN3-216ENST00000545663 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CLSTN3-216ENST00000545663 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.71■■□□□ 1.39
CLSTN3-216ENST00000545663 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.71■■□□□ 1.39
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CLSTN3-216ENST00000545663 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.67■■□□□ 1.38
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CLSTN3-216ENST00000545663 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3-216ENST00000545663 SPON1Q9HCB6 807 aa23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3-216ENST00000545663 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3-216ENST00000545663 ABCA3Q99758 1704 aa23.66■■□□□ 1.38
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CLSTN3-216ENST00000545663 KIF1AQ12756 1690 aa23.64■■□□□ 1.38
CLSTN3-216ENST00000545663 CEP350Q5VT06 3117 aa23.64■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.64■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.64■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 SBNO1A3KN83 1393 aa23.63■■□□□ 1.37
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CLSTN3-216ENST00000545663 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGEF10O15013 1369 aa23.61■■□□□ 1.37
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CLSTN3-216ENST00000545663 C1QTNF8P60827 252 aa23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 ADGRB2O60241 1585 aa23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 TECPR2O15040 1411 aa23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3-216ENST00000545663 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.57■■□□□ 1.36
CLSTN3-216ENST00000545663 RREB1Q92766 1687 aa23.57■■□□□ 1.36
CLSTN3-216ENST00000545663 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3-216ENST00000545663 ABCC11Q96J66 1382 aa23.55■■□□□ 1.36
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