RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 SLAIN2Q9P270 581 aa26.42■■□□□ 1.82
COPS7A-216ENST00000543170 ADGRB2O60241 1585 aa26.41■■□□□ 1.82
COPS7A-216ENST00000543170 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.4■■□□□ 1.82
COPS7A-216ENST00000543170 PRAM1Q96QH2 718 aa26.37■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.37■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.36■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.36■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.36■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.36■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.34■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.34■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.33■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 POGKQ9P215 609 aa26.33■■□□□ 1.81
COPS7A-216ENST00000543170 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
COPS7A-216ENST00000543170 HSPA1LP34931 641 aa26.31■■□□□ 1.8
COPS7A-216ENST00000543170 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.29■■□□□ 1.8
COPS7A-216ENST00000543170 PHLPP1O60346 1717 aa26.28■■□□□ 1.8
COPS7A-216ENST00000543170 BRINP3Q76B58 766 aa26.28■■□□□ 1.8
COPS7A-216ENST00000543170 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
COPS7A-216ENST00000543170 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.25■■□□□ 1.79
COPS7A-216ENST00000543170 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
COPS7A-216ENST00000543170 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.24■■□□□ 1.79
COPS7A-216ENST00000543170 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
COPS7A-216ENST00000543170 KIF1AQ12756 1690 aa26.23■■□□□ 1.79
COPS7A-216ENST00000543170 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.22■■□□□ 1.79
COPS7A-216ENST00000543170 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
COPS7A-216ENST00000543170 USP32Q8NFA0 1604 aa26.21■■□□□ 1.79
COPS7A-216ENST00000543170 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
COPS7A-216ENST00000543170 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
COPS7A-216ENST00000543170 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.18■■□□□ 1.78
COPS7A-216ENST00000543170 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
COPS7A-216ENST00000543170 ORAI2Q96SN7 254 aa26.16■■□□□ 1.78
COPS7A-216ENST00000543170 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
COPS7A-216ENST00000543170 ITSN1Q15811 1721 aa26.15■■□□□ 1.78
COPS7A-216ENST00000543170 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.14■■□□□ 1.78
COPS7A-216ENST00000543170 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.14■■□□□ 1.78
COPS7A-216ENST00000543170 SHPRHQ149N8 1683 aa26.13■■□□□ 1.77
COPS7A-216ENST00000543170 ATP7BP35670 1465 aa26.13■■□□□ 1.77
COPS7A-216ENST00000543170 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.12■■□□□ 1.77
COPS7A-216ENST00000543170 NUTM2FA1L443 756 aa26.12■■□□□ 1.77
COPS7A-216ENST00000543170 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.11■■□□□ 1.77
COPS7A-216ENST00000543170 JCADQ9P266 1359 aa26.1■■□□□ 1.77
COPS7A-216ENST00000543170 PXDNQ92626 1479 aa26.09■■□□□ 1.77
COPS7A-216ENST00000543170 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
COPS7A-216ENST00000543170 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.09■■□□□ 1.77
COPS7A-216ENST00000543170 CDK19Q9BWU1 502 aa26.06■■□□□ 1.76
COPS7A-216ENST00000543170 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.06■■□□□ 1.76
COPS7A-216ENST00000543170 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
COPS7A-216ENST00000543170 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
COPS7A-216ENST00000543170 EVC2Q86UK5 1308 aa26.03■■□□□ 1.76
COPS7A-216ENST00000543170 FOXO3O43524 673 aa26.02■■□□□ 1.76
COPS7A-216ENST00000543170 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
COPS7A-216ENST00000543170 USP47Q96K76 1375 aa26.01■■□□□ 1.75
COPS7A-216ENST00000543170 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
COPS7A-216ENST00000543170 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26■■□□□ 1.75
COPS7A-216ENST00000543170 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.99■■□□□ 1.75
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.99■■□□□ 1.75
COPS7A-216ENST00000543170 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
COPS7A-216ENST00000543170 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
COPS7A-216ENST00000543170 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
COPS7A-216ENST00000543170 SLC24A1O60721 1099 aa25.96■■□□□ 1.75
COPS7A-216ENST00000543170 SBNO1A3KN83 1393 aa25.95■■□□□ 1.75
COPS7A-216ENST00000543170 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.95■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 CABP2Q9NPB3 220 aa25.95■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.95■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.95■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.94■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.94■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 TESK2Q96S53 571 aa25.94■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.94■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 PSME1Q06323 249 aa25.93■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.93■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 LRP6O75581 1613 aa25.92■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.91■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 ALS2Q96Q42 1657 aa25.91■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
COPS7A-216ENST00000543170 ARHGEF10O15013 1369 aa25.88■■□□□ 1.73
COPS7A-216ENST00000543170 ACEP12821 1306 aa25.88■■□□□ 1.73
COPS7A-216ENST00000543170 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
COPS7A-216ENST00000543170 AKAP12Q02952 1782 aa25.86■■□□□ 1.73
COPS7A-216ENST00000543170 ABCA3Q99758 1704 aa25.83■■□□□ 1.73
COPS7A-216ENST00000543170 CABP1Q9NZU7 370 aa25.83■■□□□ 1.73
COPS7A-216ENST00000543170 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.82■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.82■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 USP6P35125 1406 aa25.81■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 TMF1P82094 1093 aa25.81■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.8■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.8■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.8■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
COPS7A-216ENST00000543170 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
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