RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540963.1

CHFR-218, Transcript of checkpoint with forkhead and ring finger domains, humanhuman

TSL 2

Gene CHFR, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFR-218ENST00000540963 USP21Q9UK80 565 aa40.43■■■■■ 4.06
CHFR-218ENST00000540963 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
CHFR-218ENST00000540963 ATAD2Q6PL18 1390 aa40.4■■■■■ 4.06
CHFR-218ENST00000540963 NPHP3Q7Z494 1330 aa40.4■■■■■ 4.06
CHFR-218ENST00000540963 MYOM2P54296 1465 aa40.36■■■■■ 4.05
CHFR-218ENST00000540963 ATRNO75882 1429 aa40.34■■■■■ 4.05
CHFR-218ENST00000540963 ESCO1Q5FWF5 840 aa40.32■■■■■ 4.05
CHFR-218ENST00000540963 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
CHFR-218ENST00000540963 PXDNQ92626 1479 aa40.32■■■■■ 4.04
CHFR-218ENST00000540963 TECPR2O15040 1411 aa40.31■■■■■ 4.04
CHFR-218ENST00000540963 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
CHFR-218ENST00000540963 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.25■■■■■ 4.03
CHFR-218ENST00000540963 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.24■■■■■ 4.03
CHFR-218ENST00000540963 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.23■■■■■ 4.03
CHFR-218ENST00000540963 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.23■■■■■ 4.03
CHFR-218ENST00000540963 IFT172Q9UG01 1749 aa40.23■■■■■ 4.03
CHFR-218ENST00000540963 FOXD1Q16676 465 aa40.23■■■■■ 4.03
CHFR-218ENST00000540963 BCL9LQ86UU0 1499 aa40.23■■■■■ 4.03
CHFR-218ENST00000540963 FOXO3O43524 673 aa40.22■■■■■ 4.03
CHFR-218ENST00000540963 ABCC11Q96J66 1382 aa40.22■■■■■ 4.03
CHFR-218ENST00000540963 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.21■■■■■ 4.03
CHFR-218ENST00000540963 CCDC125Q86Z20 511 aa40.18■■■■■ 4.02
CHFR-218ENST00000540963 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
CHFR-218ENST00000540963 EP400Q96L91 3159 aa40.16■■■■■ 4.02
CHFR-218ENST00000540963 KIF1AQ12756 1690 aa40.15■■■■■ 4.02
CHFR-218ENST00000540963 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.14■■■■■ 4.02
CHFR-218ENST00000540963 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.14■■■■■ 4.02
CHFR-218ENST00000540963 STK26Q9P289 416 aa40.14■■■■■ 4.02
CHFR-218ENST00000540963 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
CHFR-218ENST00000540963 PIK3C2GO75747 1445 aa40.12■■■■■ 4.01
CHFR-218ENST00000540963 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
CHFR-218ENST00000540963 RGL3Q3MIN7 710 aa40.11■■■■■ 4.01
CHFR-218ENST00000540963 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa40.11■■■■■ 4.01
CHFR-218ENST00000540963 SIRT1Q96EB6 747 aa40.08■■■■■ 4.01
CHFR-218ENST00000540963 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa40.08■■■■■ 4.01
CHFR-218ENST00000540963 ZRANB1Q9UGI0 708 aa40.07■■■■■ 4.01
CHFR-218ENST00000540963 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.06■■■■■ 4
CHFR-218ENST00000540963 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
CHFR-218ENST00000540963 SLIT2O94813 1529 aa40.06■■■■■ 4
CHFR-218ENST00000540963 NUTM2FA1L443 756 aa40.05■■■■■ 4
CHFR-218ENST00000540963 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.05■■■■■ 4
CHFR-218ENST00000540963 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.04■■■■■ 4
CHFR-218ENST00000540963 UNC5CLQ8IV45 518 aa40.04■■■■■ 4
CHFR-218ENST00000540963 USP32Q8NFA0 1604 aa40■■■■□ 3.99
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CHFR-218ENST00000540963 GLI3P10071 1580 aa39.98■■■■□ 3.99
CHFR-218ENST00000540963 RALGAPBQ86X10 1494 aa39.98■■■■□ 3.99
CHFR-218ENST00000540963 KRT28Q7Z3Y7 464 aa39.97■■■■□ 3.99
CHFR-218ENST00000540963 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
CHFR-218ENST00000540963 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
CHFR-218ENST00000540963 PSME1Q06323 249 aa39.93■■■■□ 3.98
CHFR-218ENST00000540963 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.93■■■■□ 3.98
CHFR-218ENST00000540963 TNS3Q68CZ2 1445 aa39.92■■■■□ 3.98
CHFR-218ENST00000540963 PHF8Q9UPP1 1060 aa39.91■■■■□ 3.98
CHFR-218ENST00000540963 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
CHFR-218ENST00000540963 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
CHFR-218ENST00000540963 NWD2Q9ULI1 1742 aa39.89■■■■□ 3.98
CHFR-218ENST00000540963 SBNO1A3KN83 1393 aa39.88■■■■□ 3.97
CHFR-218ENST00000540963 BRWD3Q6RI45 1802 aa39.87■■■■□ 3.97
CHFR-218ENST00000540963 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
CHFR-218ENST00000540963 VPS72Q15906 364 aa39.84■■■■□ 3.97
CHFR-218ENST00000540963 ARHGEF10O15013 1369 aa39.84■■■■□ 3.97
CHFR-218ENST00000540963 PLCH1Q4KWH8 1693 aa39.83■■■■□ 3.97
CHFR-218ENST00000540963 ABCA3Q99758 1704 aa39.82■■■■□ 3.96
CHFR-218ENST00000540963 DLC1Q96QB1 1528 aa39.81■■■■□ 3.96
CHFR-218ENST00000540963 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CHFR-218ENST00000540963 ANKARQ7Z5J8 1434 aa39.8■■■■□ 3.96
CHFR-218ENST00000540963 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.79■■■■□ 3.96
CHFR-218ENST00000540963 SEPT12Q8IYM1 358 aa39.77■■■■□ 3.96
CHFR-218ENST00000540963 PRAM1Q96QH2 718 aa39.77■■■■□ 3.96
CHFR-218ENST00000540963 CABLES1Q8TDN4 633 aa39.75■■■■□ 3.95
CHFR-218ENST00000540963 ADGRB2O60241 1585 aa39.75■■■■□ 3.95
CHFR-218ENST00000540963 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
CHFR-218ENST00000540963 POGKQ9P215 609 aa39.69■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 LMOD2Q6P5Q4 547 aa39.68■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP39.67■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 KRT27Q7Z3Y8 459 aa39.67■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 FAM83GA6ND36 823 aa39.65■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 DEFB132Q7Z7B7 95 aa39.65■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 ADGRB1O14514 1584 aa39.64■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 NRAPQ86VF7 1730 aa39.63■■■■□ 3.94
CHFR-218ENST00000540963 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa39.62■■■■□ 3.93
CHFR-218ENST00000540963 ALS2Q96Q42 1657 aa39.61■■■■□ 3.93
CHFR-218ENST00000540963 GPRASP1Q5JY77 1395 aa39.59■■■■□ 3.93
CHFR-218ENST00000540963 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
CHFR-218ENST00000540963 PLEKHG5O94827 1062 aa39.57■■■■□ 3.93
CHFR-218ENST00000540963 TULP4Q9NRJ4 1543 aa39.55■■■■□ 3.92
CHFR-218ENST00000540963 LRP5O75197 1615 aa39.55■■■■□ 3.92
CHFR-218ENST00000540963 STAC3Q96MF2 364 aa39.53■■■■□ 3.92
CHFR-218ENST00000540963 BTG4Q9NY30 223 aa39.53■■■■□ 3.92
CHFR-218ENST00000540963 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.52■■■■□ 3.92
CHFR-218ENST00000540963 BAG6P46379 1132 aa39.51■■■■□ 3.92
CHFR-218ENST00000540963 PRR36Q9H6K5 1346 aa39.49■■■■□ 3.91
CHFR-218ENST00000540963 A0A0G2JS52 829 aa39.49■■■■□ 3.91
CHFR-218ENST00000540963 MYT1Q01538 1121 aa39.49■■■■□ 3.91
CHFR-218ENST00000540963 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa39.48■■■■□ 3.91
CHFR-218ENST00000540963 WASLO00401 505 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
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