RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 ADGRB1O14514 1584 aa34.95■■■■□ 3.18
PITX3-202ENST00000539804 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
PITX3-202ENST00000539804 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.92■■■■□ 3.18
PITX3-202ENST00000539804 PRAM1Q96QH2 718 aa34.91■■■■□ 3.18
PITX3-202ENST00000539804 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.88■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.87■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.87■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.87■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 NEUROD1Q13562 356 aa34.86■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.84■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.84■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.84■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.81■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 ORAI2Q96SN7 254 aa34.8■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 SHPRHQ149N8 1683 aa34.79■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.78■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.77■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 ADGRB2O60241 1585 aa34.77■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
PITX3-202ENST00000539804 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX3-202ENST00000539804 TONSLQ96HA7 1378 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX3-202ENST00000539804 KIF1AQ12756 1690 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2FA1L443 756 aa34.69■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.66■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 FOXO3O43524 673 aa34.65■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.65■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 PSME1Q06323 249 aa34.64■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.62■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.61■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.6■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.59■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 PXDNQ92626 1479 aa34.58■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.57■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 ILDR2Q71H61 639 aa34.55■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.54■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 LRP6O75581 1613 aa34.52■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.51■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 CDK19Q9BWU1 502 aa34.5■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.5■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 SBNO1A3KN83 1393 aa34.49■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 ITSN1Q15811 1721 aa34.49■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 USP32Q8NFA0 1604 aa34.48■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.48■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 ARHGEF10O15013 1369 aa34.46■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.45■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.45■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.44■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.44■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 SOCS7O14512 581 aa34.43■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.43■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.43■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 ATP7BP35670 1465 aa34.42■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.42■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 EVC2Q86UK5 1308 aa34.42■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.41■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 C8orf37Q96NL8 207 aa34.38■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 SLC24A1O60721 1099 aa34.37■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 NGLY1Q96IV0 654 aa34.37■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTS2O95450 1211 aa34.36■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 AFF2P51816 1311 aa34.35■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.35■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.34■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 POTEAQ6S8J7 498 aa34.33■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.33■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.29■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 CABP2Q9NPB3 220 aa34.27■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.27■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 ACEP12821 1306 aa34.27■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 RXRBP28702 533 aa34.26■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
PITX3-202ENST00000539804 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.24■■■■□ 3.07
PITX3-202ENST00000539804 USP21Q9UK80 565 aa34.23■■■■□ 3.07
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