RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-215ENST00000539613 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
RHBDD1-215ENST00000539613 ATAD2Q6PL18 1390 aa31.23■■■□□ 2.59
RHBDD1-215ENST00000539613 ESCO1Q5FWF5 840 aa31.2■■■□□ 2.59
RHBDD1-215ENST00000539613 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
RHBDD1-215ENST00000539613 NPHP3Q7Z494 1330 aa31.2■■■□□ 2.58
RHBDD1-215ENST00000539613 IFT172Q9UG01 1749 aa31.19■■■□□ 2.58
RHBDD1-215ENST00000539613 MYOM2P54296 1465 aa31.17■■■□□ 2.58
RHBDD1-215ENST00000539613 PXDNQ92626 1479 aa31.17■■■□□ 2.58
RHBDD1-215ENST00000539613 KNDC1Q76NI1 1749 aa31.16■■■□□ 2.58
RHBDD1-215ENST00000539613 FOXD1Q16676 465 aa31.16■■■□□ 2.58
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.15■■■□□ 2.58
RHBDD1-215ENST00000539613 ATRNO75882 1429 aa31.15■■■□□ 2.58
RHBDD1-215ENST00000539613 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
RHBDD1-215ENST00000539613 STK26Q9P289 416 aa31.14■■■□□ 2.58
RHBDD1-215ENST00000539613 NUTM2FA1L443 756 aa31.13■■■□□ 2.57
RHBDD1-215ENST00000539613 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
RHBDD1-215ENST00000539613 FMN2Q9NZ56 1722 aa31.12■■■□□ 2.57
RHBDD1-215ENST00000539613 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa31.11■■■□□ 2.57
RHBDD1-215ENST00000539613 FOXO3O43524 673 aa31.1■■■□□ 2.57
RHBDD1-215ENST00000539613 RGL3Q3MIN7 710 aa31.1■■■□□ 2.57
RHBDD1-215ENST00000539613 KIF1AQ12756 1690 aa31.09■■■□□ 2.57
RHBDD1-215ENST00000539613 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
RHBDD1-215ENST00000539613 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
RHBDD1-215ENST00000539613 TECPR2O15040 1411 aa31.07■■■□□ 2.57
RHBDD1-215ENST00000539613 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.06■■■□□ 2.56
RHBDD1-215ENST00000539613 EP400Q96L91 3159 aa31.05■■■□□ 2.56
RHBDD1-215ENST00000539613 BCL9LQ86UU0 1499 aa31.05■■■□□ 2.56
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.05■■■□□ 2.56
RHBDD1-215ENST00000539613 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.04■■■□□ 2.56
RHBDD1-215ENST00000539613 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.03■■■□□ 2.56
RHBDD1-215ENST00000539613 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
RHBDD1-215ENST00000539613 PIK3C2GO75747 1445 aa31.01■■■□□ 2.55
RHBDD1-215ENST00000539613 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.01■■■□□ 2.55
RHBDD1-215ENST00000539613 USP32Q8NFA0 1604 aa31.01■■■□□ 2.55
RHBDD1-215ENST00000539613 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
RHBDD1-215ENST00000539613 ABCC11Q96J66 1382 aa30.97■■■□□ 2.55
RHBDD1-215ENST00000539613 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
RHBDD1-215ENST00000539613 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.96■■■□□ 2.55
RHBDD1-215ENST00000539613 GLI3P10071 1580 aa30.96■■■□□ 2.55
RHBDD1-215ENST00000539613 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.94■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa30.94■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.94■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.93■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.93■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.93■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 ABCA3Q99758 1704 aa30.93■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 PLEKHG5O94827 1062 aa30.92■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 SLIT2O94813 1529 aa30.91■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.9■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.9■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.89■■■□□ 2.54
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC125Q86Z20 511 aa30.88■■■□□ 2.53
RHBDD1-215ENST00000539613 NWD2Q9ULI1 1742 aa30.87■■■□□ 2.53
RHBDD1-215ENST00000539613 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.84■■■□□ 2.53
RHBDD1-215ENST00000539613 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.84■■■□□ 2.53
RHBDD1-215ENST00000539613 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.84■■■□□ 2.53
RHBDD1-215ENST00000539613 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
RHBDD1-215ENST00000539613 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
RHBDD1-215ENST00000539613 PSME1Q06323 249 aa30.81■■■□□ 2.52
RHBDD1-215ENST00000539613 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.81■■■□□ 2.52
RHBDD1-215ENST00000539613 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.81■■■□□ 2.52
RHBDD1-215ENST00000539613 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.78■■■□□ 2.52
RHBDD1-215ENST00000539613 PRAM1Q96QH2 718 aa30.78■■■□□ 2.52
RHBDD1-215ENST00000539613 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
RHBDD1-215ENST00000539613 ARHGEF10O15013 1369 aa30.77■■■□□ 2.52
RHBDD1-215ENST00000539613 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 SIRT1Q96EB6 747 aa30.76■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 SBNO1A3KN83 1393 aa30.75■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 ADGRB2O60241 1585 aa30.75■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 A0A0G2JS52 829 aa30.74■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 MYT1Q01538 1121 aa30.74■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 SEPT12Q8IYM1 358 aa30.74■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 VPS72Q15906 364 aa30.73■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 POGKQ9P215 609 aa30.73■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 NRAPQ86VF7 1730 aa30.73■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 DLC1Q96QB1 1528 aa30.73■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 DEFB132Q7Z7B7 95 aa30.71■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.71■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.71■■■□□ 2.51
RHBDD1-215ENST00000539613 ALS2Q96Q42 1657 aa30.67■■■□□ 2.5
RHBDD1-215ENST00000539613 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
RHBDD1-215ENST00000539613 KRT27Q7Z3Y8 459 aa30.65■■■□□ 2.5
RHBDD1-215ENST00000539613 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
RHBDD1-215ENST00000539613 ADGRB1O14514 1584 aa30.65■■■□□ 2.5
RHBDD1-215ENST00000539613 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
RHBDD1-215ENST00000539613 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.62■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.62■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.61■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM83GA6ND36 823 aa30.6■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 ITSN1Q15811 1721 aa30.6■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.59■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.59■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 LRP5O75197 1615 aa30.58■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
RHBDD1-215ENST00000539613 BTG4Q9NY30 223 aa30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms