RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533080.5

TSPAN18-211, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN18, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-211ENST00000533080 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.45■■■□□ 2.3
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TSPAN18-211ENST00000533080 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.37■■■□□ 2.29
TSPAN18-211ENST00000533080 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
TSPAN18-211ENST00000533080 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.33■■■□□ 2.29
TSPAN18-211ENST00000533080 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.33■■■□□ 2.29
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TSPAN18-211ENST00000533080 FOXO3O43524 673 aa29.29■■■□□ 2.28
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TSPAN18-211ENST00000533080 TECPR2O15040 1411 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPAN18-211ENST00000533080 SLIT2O94813 1529 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPAN18-211ENST00000533080 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.18■■■□□ 2.26
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TSPAN18-211ENST00000533080 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.17■■■□□ 2.26
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TSPAN18-211ENST00000533080 ABCC11Q96J66 1382 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPAN18-211ENST00000533080 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.14■■■□□ 2.26
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TSPAN18-211ENST00000533080 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.12■■■□□ 2.25
TSPAN18-211ENST00000533080 GLI3P10071 1580 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPAN18-211ENST00000533080 PSME1Q06323 249 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPAN18-211ENST00000533080 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.11■■■□□ 2.25
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TSPAN18-211ENST00000533080 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.09■■■□□ 2.25
TSPAN18-211ENST00000533080 USP32Q8NFA0 1604 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPAN18-211ENST00000533080 RGL3Q3MIN7 710 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN18-211ENST00000533080 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.05■■■□□ 2.24
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TSPAN18-211ENST00000533080 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN18-211ENST00000533080 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.04■■■□□ 2.24
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TSPAN18-211ENST00000533080 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.03■■■□□ 2.24
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TSPAN18-211ENST00000533080 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29■■■□□ 2.23
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TSPAN18-211ENST00000533080 IFT172Q9UG01 1749 aa28.93■■■□□ 2.22
TSPAN18-211ENST00000533080 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.92■■■□□ 2.22
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TSPAN18-211ENST00000533080 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.87■■■□□ 2.21
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TSPAN18-211ENST00000533080 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
TSPAN18-211ENST00000533080 BTG4Q9NY30 223 aa28.82■■■□□ 2.2
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TSPAN18-211ENST00000533080 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
TSPAN18-211ENST00000533080 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPAN18-211ENST00000533080 NRAPQ86VF7 1730 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPAN18-211ENST00000533080 DISP2A7MBM2 1401 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPAN18-211ENST00000533080 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.74■■■□□ 2.19
TSPAN18-211ENST00000533080 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.74■■■□□ 2.19
TSPAN18-211ENST00000533080 ADGRB2O60241 1585 aa28.73■■■□□ 2.19
TSPAN18-211ENST00000533080 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
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