RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1-206ENST00000526095 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1-206ENST00000526095 STK26Q9P289 416 aa23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1-206ENST00000526095 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1-206ENST00000526095 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 ABCC11Q96J66 1382 aa23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 MYOM2P54296 1465 aa23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 C8orf37Q96NL8 207 aa23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 PXDNQ92626 1479 aa23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 RXRBP28702 533 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-206ENST00000526095 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-206ENST00000526095 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-206ENST00000526095 NUTM2FA1L443 756 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-206ENST00000526095 ADAMTS2O95450 1211 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-206ENST00000526095 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-206ENST00000526095 KIF1AQ12756 1690 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-206ENST00000526095 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-206ENST00000526095 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-206ENST00000526095 FOXO3O43524 673 aa23.14■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 RGS12O14924 1447 aa23.14■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 NGLY1Q96IV0 654 aa23.13■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 SIRT1Q96EB6 747 aa23.12■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 ADGRB1O14514 1584 aa23.11■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 DLC1Q96QB1 1528 aa23.11■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 USP32Q8NFA0 1604 aa23.08■■□□□ 1.29
KCNQ1-206ENST00000526095 ADGRB2O60241 1585 aa23.07■■□□□ 1.28
KCNQ1-206ENST00000526095 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
KCNQ1-206ENST00000526095 PRAM1Q96QH2 718 aa23.06■■□□□ 1.28
KCNQ1-206ENST00000526095 USP21Q9UK80 565 aa23.06■■□□□ 1.28
KCNQ1-206ENST00000526095 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
KCNQ1-206ENST00000526095 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
KCNQ1-206ENST00000526095 ATRNO75882 1429 aa23.04■■□□□ 1.28
KCNQ1-206ENST00000526095 ABCA3Q99758 1704 aa23.04■■□□□ 1.28
KCNQ1-206ENST00000526095 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.03■■□□□ 1.28
KCNQ1-206ENST00000526095 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.02■■□□□ 1.28
KCNQ1-206ENST00000526095 HRCP23327 699 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 POGKQ9P215 609 aa22.99■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.99■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.99■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.98■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.97■■□□□ 1.27
KCNQ1-206ENST00000526095 SLIT2O94813 1529 aa22.95■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.94■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 GLI3P10071 1580 aa22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 SBNO1A3KN83 1393 aa22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 ALS2Q96Q42 1657 aa22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.92■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 PSME1Q06323 249 aa22.92■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.92■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 STAC3Q96MF2 364 aa22.92■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.91■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.91■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.91■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 ITSN1Q15811 1721 aa22.91■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.9■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.9■■□□□ 1.26
KCNQ1-206ENST00000526095 ARHGEF10O15013 1369 aa22.89■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.88■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.88■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 PLEKHG5O94827 1062 aa22.88■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.88■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 EP400Q96L91 3159 aa22.87■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.86■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 NRAPQ86VF7 1730 aa22.85■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 ATP7BP35670 1465 aa22.84■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.84■■□□□ 1.25
KCNQ1-206ENST00000526095 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.82■■□□□ 1.24
KCNQ1-206ENST00000526095 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
KCNQ1-206ENST00000526095 VPS72Q15906 364 aa22.78■■□□□ 1.24
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM83GA6ND36 823 aa22.77■■□□□ 1.24
KCNQ1-206ENST00000526095 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
KCNQ1-206ENST00000526095 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
KCNQ1-206ENST00000526095 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
KCNQ1-206ENST00000526095 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.74■■□□□ 1.23
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