RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525786.1

CCDC82-204, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC82, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-204ENST00000525786 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CCDC82-204ENST00000525786 NUP155O75694 1391 aa25.9■■□□□ 1.74
CCDC82-204ENST00000525786 GLI3P10071 1580 aa25.89■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 KIF1BO60333 1816 aa25.88■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.88■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.87■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.85■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.85■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 PXDNQ92626 1479 aa25.85■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 ROCK1Q13464 1354 aa25.84■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 CLTCL1P53675 1640 aa25.84■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.83■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.83■■□□□ 1.73
CCDC82-204ENST00000525786 HFM1A2PYH4 1435 aa25.81■■□□□ 1.72
CCDC82-204ENST00000525786 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.81■■□□□ 1.72
CCDC82-204ENST00000525786 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.8■■□□□ 1.72
CCDC82-204ENST00000525786 SLIT2O94813 1529 aa25.79■■□□□ 1.72
CCDC82-204ENST00000525786 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.79■■□□□ 1.72
CCDC82-204ENST00000525786 USP32Q8NFA0 1604 aa25.78■■□□□ 1.72
CCDC82-204ENST00000525786 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CCDC82-204ENST00000525786 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.74■■□□□ 1.71
CCDC82-204ENST00000525786 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CCDC82-204ENST00000525786 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.73■■□□□ 1.71
CCDC82-204ENST00000525786 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CCDC82-204ENST00000525786 FOXO3O43524 673 aa25.72■■□□□ 1.71
CCDC82-204ENST00000525786 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.72■■□□□ 1.71
CCDC82-204ENST00000525786 KIF1AQ12756 1690 aa25.71■■□□□ 1.71
CCDC82-204ENST00000525786 HRCP23327 699 aa25.7■■□□□ 1.7
CCDC82-204ENST00000525786 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CCDC82-204ENST00000525786 BAG6P46379 1132 aa25.69■■□□□ 1.7
CCDC82-204ENST00000525786 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.68■■□□□ 1.7
CCDC82-204ENST00000525786 PPLO60437 1756 aa25.67■■□□□ 1.7
CCDC82-204ENST00000525786 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.66■■□□□ 1.7
CCDC82-204ENST00000525786 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.64■■□□□ 1.7
CCDC82-204ENST00000525786 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CCDC82-204ENST00000525786 VPS72Q15906 364 aa25.64■■□□□ 1.7
CCDC82-204ENST00000525786 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CCDC82-204ENST00000525786 NAIPQ13075 1403 aa25.63■■□□□ 1.69
CCDC82-204ENST00000525786 ABCA3Q99758 1704 aa25.63■■□□□ 1.69
CCDC82-204ENST00000525786 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.63■■□□□ 1.69
CCDC82-204ENST00000525786 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.63■■□□□ 1.69
CCDC82-204ENST00000525786 A0A0G2JS52 829 aa25.6■■□□□ 1.69
CCDC82-204ENST00000525786 MYT1Q01538 1121 aa25.6■■□□□ 1.69
CCDC82-204ENST00000525786 NUTM2FA1L443 756 aa25.59■■□□□ 1.69
CCDC82-204ENST00000525786 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CCDC82-204ENST00000525786 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.57■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 ITGAEP38570 1179 aa25.57■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.57■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.56■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 NRAPQ86VF7 1730 aa25.54■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 IFT172Q9UG01 1749 aa25.54■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.52■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 TECPR2O15040 1411 aa25.52■■□□□ 1.68
CCDC82-204ENST00000525786 ADGRB2O60241 1585 aa25.51■■□□□ 1.67
CCDC82-204ENST00000525786 YY1P25490 414 aa25.5■■□□□ 1.67
CCDC82-204ENST00000525786 DISP2A7MBM2 1401 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC82-204ENST00000525786 PLEKHG5O94827 1062 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC82-204ENST00000525786 PSME1Q06323 249 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC82-204ENST00000525786 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC82-204ENST00000525786 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CCDC82-204ENST00000525786 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.47■■□□□ 1.67
CCDC82-204ENST00000525786 ARHGEF10O15013 1369 aa25.46■■□□□ 1.67
CCDC82-204ENST00000525786 STK26Q9P289 416 aa25.46■■□□□ 1.67
CCDC82-204ENST00000525786 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CCDC82-204ENST00000525786 SBNO1A3KN83 1393 aa25.44■■□□□ 1.66
CCDC82-204ENST00000525786 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.43■■□□□ 1.66
CCDC82-204ENST00000525786 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CCDC82-204ENST00000525786 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.42■■□□□ 1.66
CCDC82-204ENST00000525786 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.42■■□□□ 1.66
CCDC82-204ENST00000525786 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.41■■□□□ 1.66
CCDC82-204ENST00000525786 ABCC11Q96J66 1382 aa25.41■■□□□ 1.66
CCDC82-204ENST00000525786 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC82-204ENST00000525786 FAM83GA6ND36 823 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 BTG4Q9NY30 223 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 RREB1Q92766 1687 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 FAM182BQ5T319 152 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.34■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.34■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.34■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CCDC82-204ENST00000525786 ALS2Q96Q42 1657 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.31■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.31■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.3■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 PIK3C2GO75747 1445 aa25.29■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.29■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 TRIM37O94972 964 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC82-204ENST00000525786 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC82-204ENST00000525786 APBA3O96018 575 aa25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms