RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525524.1

EDRF1-211, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene EDRF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-211ENST00000525524 AXIN1O15169 862 aa8.56□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.55□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 BRICD5Q6PL45 260 aa8.55□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.55□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.54□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 GPR37O15354 613 aa8.54□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 AVPP01185 164 aa8.53□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 NLRP7Q8WX94 980 aa8.53□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.53□□□□□ -1.04
EDRF1-211ENST00000525524 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 USP46P62068 366 aa8.51□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 MAP2K5Q13163 448 aa8.5□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.5□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.5□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 WNT7AO00755 349 aa8.49□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 KDM4AO75164 1064 aa8.49□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 DACH1Q9UI36 760 aa8.49□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.48□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 CD46P15529 392 aa8.48□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 MMP16P51512 607 aa8.48□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 TRIM32Q13049 653 aa8.48□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 PHOX2BQ99453 314 aa8.47□□□□□ -1.05
EDRF1-211ENST00000525524 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.46□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 SENP2Q9HC62 589 aa8.46□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 IRF6O14896 467 aa8.43□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 WNT7BP56706 349 aa8.43□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.43□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 CLCN1P35523 988 aa8.42□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.42□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 KIFC2Q96AC6 838 aa8.42□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 SMPD1P17405 629 aa8.41□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 HOXA2O43364 376 aa8.4□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.4□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.4□□□□□ -1.06
EDRF1-211ENST00000525524 JUNDP17535 347 aa8.39□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.37□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 J3QL48 77 aa8.37□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 RETREG3Q86VR2 466 aa8.37□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.37□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 CCDC102AQ96A19 550 aa8.37□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 TRIM47Q96LD4 638 aa8.37□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 LCE2CQ5TA81 110 aa8.36□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 ALDH1A1P00352 501 aa8.35□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.35□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.35□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.35□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.35□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 NACADO15069 1562 aa8.35□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 C6orf229H3BNL8 230 aa8.34□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.34□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 HPS1Q92902 700 aa8.34□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
EDRF1-211ENST00000525524 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 HLA-CQ95604 372 aa8.33□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 FDX1P10109 184 aa8.32□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 MS4A1P11836 297 aa8.32□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 SKOR1P84550 965 aa8.31□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 GUCA2AQ02747 115 aa8.31□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.31□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.3□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.29□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.28□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 PTPRNQ16849 979 aa8.28□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 IRF7Q92985 503 aa8.28□□□□□ -1.08
EDRF1-211ENST00000525524 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.27□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.27□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.27□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 GMPRP36959 345 aa8.25□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 SIAH2O43255 324 aa8.24□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 MTMR2Q13614 643 aa8.24□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.24□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.24□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 SH3BP2P78314 561 aa8.23□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 KCNH2Q12809 1159 aa8.23□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.23□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 SCARF1Q14162 830 aa8.22□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 DESI1Q6ICB0 168 aa8.22□□□□□ -1.09
EDRF1-211ENST00000525524 PRR7Q8TB68 274 aa8.22□□□□□ -1.09
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