RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, human

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSNARE1-208	ENST00000524325	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TSNARE1-208	ENST00000524325	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TSNARE1-208	ENST00000524325	TMEM94	Q12767	1356 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TSNARE1-208	ENST00000524325	TMF1	P82094	1093 aa		31.76	■■■□□ 2.68
TSNARE1-208	ENST00000524325	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TSNARE1-208	ENST00000524325	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TSNARE1-208	ENST00000524325	NUTM2F	A1L443	756 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TSNARE1-208	ENST00000524325	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TSNARE1-208	ENST00000524325	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
TSNARE1-208	ENST00000524325	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
TSNARE1-208	ENST00000524325	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TSNARE1-208	ENST00000524325	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TSNARE1-208	ENST00000524325	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TSNARE1-208	ENST00000524325	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TSNARE1-208	ENST00000524325	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.66
TSNARE1-208	ENST00000524325	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TSNARE1-208	ENST00000524325	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
TSNARE1-208	ENST00000524325	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TSNARE1-208	ENST00000524325	CCDC7	Q96M83	1385 aa		31.66	■■■□□ 2.66
TSNARE1-208	ENST00000524325	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.64	■■■□□ 2.65
TSNARE1-208	ENST00000524325	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.61	■■■□□ 2.65
TSNARE1-208	ENST00000524325	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.61	■■■□□ 2.65
TSNARE1-208	ENST00000524325	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TSNARE1-208	ENST00000524325	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TSNARE1-208	ENST00000524325	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.65
TSNARE1-208	ENST00000524325	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.57	■■■□□ 2.65
TSNARE1-208	ENST00000524325	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.57	■■■□□ 2.64
TSNARE1-208	ENST00000524325	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TSNARE1-208	ENST00000524325	MSH6	P52701	1360 aa		31.54	■■■□□ 2.64
TSNARE1-208	ENST00000524325	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.54	■■■□□ 2.64
TSNARE1-208	ENST00000524325	ATF3	P18847	181 aa		31.54	■■■□□ 2.64
TSNARE1-208	ENST00000524325	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		31.53	■■■□□ 2.64
TSNARE1-208	ENST00000524325	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.52	■■■□□ 2.64
TSNARE1-208	ENST00000524325	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
TSNARE1-208	ENST00000524325	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.48	■■■□□ 2.63
TSNARE1-208	ENST00000524325	ATP7B	P35670	1465 aa		31.47	■■■□□ 2.63
TSNARE1-208	ENST00000524325	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.47	■■■□□ 2.63
TSNARE1-208	ENST00000524325	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.47	■■■□□ 2.63
TSNARE1-208	ENST00000524325	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.47	■■■□□ 2.63
TSNARE1-208	ENST00000524325	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TSNARE1-208	ENST00000524325	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
TSNARE1-208	ENST00000524325	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TSNARE1-208	ENST00000524325	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TSNARE1-208	ENST00000524325	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TSNARE1-208	ENST00000524325	PANK3	Q9H999	370 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TSNARE1-208	ENST00000524325	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TSNARE1-208	ENST00000524325	MST1R	Q04912	1400 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TSNARE1-208	ENST00000524325	DCC	P43146	1447 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TSNARE1-208	ENST00000524325	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TSNARE1-208	ENST00000524325	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TSNARE1-208	ENST00000524325	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.38	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.36	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.36	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.36	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	MYOM1	P52179	1685 aa		31.35	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	ACE	P12821	1306 aa		31.35	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325		A0A1W2PP64	1363 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.61
TSNARE1-208	ENST00000524325	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	FOXO3	O43524	673 aa		31.31	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.29	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		31.29	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		31.28	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.27	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.26	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.26	■■■□□ 2.6
TSNARE1-208	ENST00000524325	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
TSNARE1-208	ENST00000524325	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
TSNARE1-208	ENST00000524325	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
TSNARE1-208	ENST00000524325	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
TSNARE1-208	ENST00000524325	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	31.24	■■■□□ 2.59	2e-6	■■■□□ 16.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		31.23	■■■□□ 2.59
TSNARE1-208	ENST00000524325	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
TSNARE1-208	ENST00000524325	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
TSNARE1-208	ENST00000524325	TOM1	O60784	492 aa		31.21	■■■□□ 2.59
TSNARE1-208	ENST00000524325	PSME1	Q06323	249 aa		31.21	■■■□□ 2.59
TSNARE1-208	ENST00000524325	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		31.21	■■■□□ 2.59
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
TSNARE1-208	ENST00000524325	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TSNARE1-208	ENST00000524325	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TSNARE1-208	ENST00000524325	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TSNARE1-208	ENST00000524325	USP6	P35125	1406 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TSNARE1-208	ENST00000524325	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TSNARE1-208	ENST00000524325	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
TSNARE1-208	ENST00000524325	NME9	Q86XW9	330 aa		31.14	■■■□□ 2.57
TSNARE1-208	ENST00000524325	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TSNARE1-208	ENST00000524325	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TSNARE1-208	ENST00000524325	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TSNARE1-208	ENST00000524325	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.11	■■■□□ 2.57

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