RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.73□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 FDX1P10109 184 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 QPCTQ16769 361 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 ADH1BP00325 375 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 SPSB2Q99619 263 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 GOPCQ9HD26 462 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 LILRB3O75022 631 aa8.67□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 HRCP23327 699 aa8.67□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.67□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.67□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 S1PR4O95977 384 aa8.66□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 Q3C1V9 767 aa8.66□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 CFAP99D6REC4 459 aa8.65□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 MSS51Q4VC12 460 aa8.65□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.65□□□□□ -1.02
CLVS1-209ENST00000522928 RNF223E7ERA6 249 aa8.64□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 MMP16P51512 607 aa8.64□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.64□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.63□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 RETREG3Q86VR2 466 aa8.63□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.63□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 C6orf229H3BNL8 230 aa8.62□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 MTMR2Q13614 643 aa8.62□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.61□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 PRR7Q8TB68 274 aa8.61□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.61□□□□□ -1.03
CLVS1-209ENST00000522928 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 JUNDP17535 347 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 LAPTM4AQ15012 233 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.57□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 DESI1Q6ICB0 168 aa8.57□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.57□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 LYPD8Q6UX82 237 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 RFC5P40937 340 aa8.54□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.54□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CLVS1-209ENST00000522928 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 GGCXP38435 758 aa8.51□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 PTPRNQ16849 979 aa8.51□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.51□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.51□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 GFRA3O60609 400 aa8.5□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.5□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.5□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.5□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF787Q6DD87 383 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 SLC19A1P41440 591 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 MAP10Q9P2G4 905 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 AP1G2O75843 785 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-209ENST00000522928 SKOR1P84550 965 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 KCNH2Q12809 1159 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 SPRYD7Q5W111 196 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 USP17L8P0C7I0 530 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 RPIAP49247 311 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 TSC1Q92574 1164 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 SNRKQ9NRH2 765 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 GPR37L1O60883 481 aa8.44□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.44□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM32Q13049 653 aa8.43□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.43□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.43□□□□□ -1.06
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