RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521478.1

HOXA6-202, Transcript of homeobox A6, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA6, Length 814 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6-202ENST00000521478 ADAMTS2O95450 1211 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 NGLY1Q96IV0 654 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 STK26Q9P289 416 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 IFT172Q9UG01 1749 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 TECPR2O15040 1411 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 ABCC11Q96J66 1382 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA6-202ENST00000521478 PIK3C2GO75747 1445 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA6-202ENST00000521478 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXA6-202ENST00000521478 FOXO3O43524 673 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA6-202ENST00000521478 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA6-202ENST00000521478 RGS12O14924 1447 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA6-202ENST00000521478 USP21Q9UK80 565 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA6-202ENST00000521478 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.11■■□□□ 1.13
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HOXA6-202ENST00000521478 NUTM2FA1L443 756 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA6-202ENST00000521478 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA6-202ENST00000521478 SIRT1Q96EB6 747 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA6-202ENST00000521478 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXA6-202ENST00000521478 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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HOXA6-202ENST00000521478 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXA6-202ENST00000521478 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXA6-202ENST00000521478 ATRNO75882 1429 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXA6-202ENST00000521478 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXA6-202ENST00000521478 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXA6-202ENST00000521478 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXA6-202ENST00000521478 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXA6-202ENST00000521478 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22■■□□□ 1.11
HOXA6-202ENST00000521478 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXA6-202ENST00000521478 KIF1AQ12756 1690 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXA6-202ENST00000521478 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXA6-202ENST00000521478 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXA6-202ENST00000521478 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXA6-202ENST00000521478 PRAM1Q96QH2 718 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXA6-202ENST00000521478 PSME1Q06323 249 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXA6-202ENST00000521478 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXA6-202ENST00000521478 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
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HOXA6-202ENST00000521478 DLC1Q96QB1 1528 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXA6-202ENST00000521478 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXA6-202ENST00000521478 SLIT2O94813 1529 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXA6-202ENST00000521478 SBNO1A3KN83 1393 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXA6-202ENST00000521478 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
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HOXA6-202ENST00000521478 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA6-202ENST00000521478 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.86■■□□□ 1.09
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HOXA6-202ENST00000521478 ADGRB2O60241 1585 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXA6-202ENST00000521478 ARHGEF10O15013 1369 aa21.85■■□□□ 1.09
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HOXA6-202ENST00000521478 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXA6-202ENST00000521478 PLEKHG5O94827 1062 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA6-202ENST00000521478 VPS72Q15906 364 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA6-202ENST00000521478 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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HOXA6-202ENST00000521478 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA6-202ENST00000521478 FAM83GA6ND36 823 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA6-202ENST00000521478 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXA6-202ENST00000521478 ABCA3Q99758 1704 aa21.79■■□□□ 1.08
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HOXA6-202ENST00000521478 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA6-202ENST00000521478 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA6-202ENST00000521478 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA6-202ENST00000521478 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA6-202ENST00000521478 EP400Q96L91 3159 aa21.77■■□□□ 1.08
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HOXA6-202ENST00000521478 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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HOXA6-202ENST00000521478 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXA6-202ENST00000521478 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.7■■□□□ 1.06
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HOXA6-202ENST00000521478 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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