RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519143.5

MRPS27-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S27, human

TSL 5

Gene MRPS27, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS27-208	ENST00000519143	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MRPS27-208	ENST00000519143	PHOX2B	Q99453	314 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPS27-208	ENST00000519143	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPS27-208	ENST00000519143	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRPS27-208	ENST00000519143	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRPS27-208	ENST00000519143	SMPD1	P17405	629 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS27-208	ENST00000519143		Q3C1V9	767 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS27-208	ENST00000519143	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS27-208	ENST00000519143	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	CD46	P15529	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	TRIM32	Q13049	653 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	NLRP7	Q8WX94	980 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	STK17A	Q9UEE5	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	SENP2	Q9HC62	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	USP46	P62068	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	TRIM47	Q96LD4	638 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143		J3QL48	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	KDM4A	O75164	1064 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	WNT7B	P56706	349 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	SKOR1	P84550	965 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	HPS1	Q92902	700 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS27-208	ENST00000519143	IRF6	O14896	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	SIAH2	O43255	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	HOXA2	O43364	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	JUND	P17535	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	PLCB2	Q00722	1185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	HLA-C	Q95604	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	RETREG3	Q86VR2	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	ALDH1A1	P00352	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	CLCN1	P35523	988 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	MPND	Q8N594	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS27-208	ENST00000519143	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	SH3BP2	P78314	561 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	CCDC102A	Q96A19	550 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143		H3BM21	787 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	PTPRN	Q16849	979 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	IRF7	Q92985	503 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	FDX1	P10109	184 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	MS4A1	P11836	297 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	GMPR	P36959	345 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	BMP1	P13497	986 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	KCNH2	Q12809	1159 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	ZFP42	Q96MM3	310 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	VSIG8	P0DPA2	414 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	GJA5	P36382	358 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	BAP1	Q92560	729 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MRPS27-208	ENST00000519143	TIMP2	P16035	220 aa		4.46	□□□□□ -1.7
MRPS27-208	ENST00000519143	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
MRPS27-208	ENST00000519143	NNT	Q13423	1086 aa		4.46	□□□□□ -1.7
MRPS27-208	ENST00000519143	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
MRPS27-208	ENST00000519143	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		4.46	□□□□□ -1.7
MRPS27-208	ENST00000519143	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.45	□□□□□ -1.7
MRPS27-208	ENST00000519143	ADH1C	P00326	375 aa		4.45	□□□□□ -1.7

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