RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.47■□□□□ 0.87
PDGFRB-202ENST00000517488 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PDGFRB-202ENST00000517488 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PDGFRB-202ENST00000517488 ADGRB1O14514 1584 aa20.46■□□□□ 0.87
PDGFRB-202ENST00000517488 NUTM2FA1L443 756 aa20.45■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.45■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 LAMC1P11047 1609 aa20.45■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.44■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.42■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 NEUROD1Q13562 356 aa20.42■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.42■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 POGKQ9P215 609 aa20.42■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.41■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PDGFRB-202ENST00000517488 DLC1Q96QB1 1528 aa20.39■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.38■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.37■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.36■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 LRP6O75581 1613 aa20.35■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 FOXO3O43524 673 aa20.35■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.34■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.33■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PDGFRB-202ENST00000517488 SOCS7O14512 581 aa20.31■□□□□ 0.84
PDGFRB-202ENST00000517488 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PDGFRB-202ENST00000517488 POTEAQ6S8J7 498 aa20.31■□□□□ 0.84
PDGFRB-202ENST00000517488 SHPRHQ149N8 1683 aa20.3■□□□□ 0.84
PDGFRB-202ENST00000517488 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.3■□□□□ 0.84
PDGFRB-202ENST00000517488 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.29■□□□□ 0.84
PDGFRB-202ENST00000517488 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PDGFRB-202ENST00000517488 PXDNQ92626 1479 aa20.28■□□□□ 0.84
PDGFRB-202ENST00000517488 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.27■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.26■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 ADGRB2O60241 1585 aa20.25■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.25■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.25■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.24■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.24■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 ADAMTS2O95450 1211 aa20.23■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 CDK19Q9BWU1 502 aa20.22■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.22■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 C8orf37Q96NL8 207 aa20.21■□□□□ 0.83
PDGFRB-202ENST00000517488 USP32Q8NFA0 1604 aa20.2■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 PSME1Q06323 249 aa20.2■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.2■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 AFF2P51816 1311 aa20.2■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 TONSLQ96HA7 1378 aa20.2■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.19■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF1AQ12756 1690 aa20.19■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 NGLY1Q96IV0 654 aa20.16■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 SBNO1A3KN83 1393 aa20.16■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP7BP35670 1465 aa20.15■□□□□ 0.82
PDGFRB-202ENST00000517488 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.14■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.14■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.13■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.13■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 PLEKHG5O94827 1062 aa20.13■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.13■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.12■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 CABP2Q9NPB3 220 aa20.12■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.1■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 ARHGEF10O15013 1369 aa20.09■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.09■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 RXRBP28702 533 aa20.09■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 ACEP12821 1306 aa20.08■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 USP21Q9UK80 565 aa20.08■□□□□ 0.81
PDGFRB-202ENST00000517488 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.06■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 EVC2Q86UK5 1308 aa20.05■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.03■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.03■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 CABP1Q9NZU7 370 aa20.03■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.02■□□□□ 0.8
PDGFRB-202ENST00000517488 ATRNO75882 1429 aa20■□□□□ 0.79
PDGFRB-202ENST00000517488 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20■□□□□ 0.79
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