RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516222.1

RNU6-561P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 561, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-561P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-561P-201ENST00000516222 SLC16A10Q8TF71 515 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-561P-201ENST00000516222 THAP11Q96EK4 314 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-561P-201ENST00000516222 DACH1Q9UI36 760 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-561P-201ENST00000516222 WIPF1O43516 503 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-561P-201ENST00000516222 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-561P-201ENST00000516222 BRICD5Q6PL45 260 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-561P-201ENST00000516222 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-561P-201ENST00000516222 TERTO14746 1132 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRIM32Q13049 653 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRIM47Q96LD4 638 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 SMPD1P17405 629 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 MRGPRX2Q96LB1 330 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 PRDM9Q9NQV7 894 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 J3QL48 77 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 MMP16P51512 607 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 WNT7BP56706 349 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 USP46P62068 366 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 KDM4AO75164 1064 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 IRF7Q92985 503 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 WASF2Q9Y6W5 498 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 ALDH1A1P00352 501 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 HPS1Q92902 700 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 DXOO77932 396 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 EHBP1Q8NDI1 1231 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 NLRP7Q8WX94 980 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-561P-201ENST00000516222 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 CD46P15529 392 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 PLEKHG3A1L390 1219 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 NUTM1Q86Y26 1132 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 PHOX2BQ99453 314 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 JUNDP17535 347 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 SCARF1Q14162 830 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 SKOR1P84550 965 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 MAP2K5Q13163 448 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 RETREG3Q86VR2 466 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 IRF6O14896 467 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 GPR37O15354 613 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 HOXA2O43364 376 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 CLCN1P35523 988 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 GMPRP36959 345 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 C6orf229H3BNL8 230 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MS4A1P11836 297 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 H3BM21 787 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 SIAH2O43255 324 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 CCNYL3P0C7X3 344 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 BMP1P13497 986 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 VARSP26640 1264 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZFP42Q96MM3 310 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPDYE5A6NIY4 337 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 UPP2O95045 317 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 FDX1P10109 184 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 VEGFBP49765 207 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 SH3BP2P78314 561 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRIM46Q7Z4K8 759 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MPNDQ8N594 471 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 EVA1BQ9NVM1 165 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 PTPRNQ16849 979 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM174AQ8TBP5 190 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 HLA-CQ95604 372 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 UNC93B1Q9H1C4 597 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MAN1A2O60476 641 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 ADH1CP00326 375 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 WDR4P57081 412 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 GUCA2AQ02747 115 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 KCNH2Q12809 1159 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 NNTQ13423 1086 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 LCE2CQ5TA81 110 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 BAP1Q92560 729 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF511Q8NB15 262 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-561P-201ENST00000516222 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPTLC1O15269 473 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-561P-201ENST00000516222 CTHP32929 405 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-561P-201ENST00000516222 PLCB2Q00722 1185 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-561P-201ENST00000516222 MTMR2Q13614 643 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-561P-201ENST00000516222 ARID5BQ14865 1188 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-561P-201ENST00000516222 AGERQ15109 404 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-561P-201ENST00000516222 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.7□□□□□ -1.66
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