RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 USP21Q9UK80 565 aa27.18■■□□□ 1.94
ITGA3-215ENST00000515147 MYOM2P54296 1465 aa27.18■■□□□ 1.94
ITGA3-215ENST00000515147 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
ITGA3-215ENST00000515147 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.16■■□□□ 1.94
ITGA3-215ENST00000515147 PXDNQ92626 1479 aa27.16■■□□□ 1.94
ITGA3-215ENST00000515147 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.15■■□□□ 1.94
ITGA3-215ENST00000515147 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
ITGA3-215ENST00000515147 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.11■■□□□ 1.93
ITGA3-215ENST00000515147 IFT172Q9UG01 1749 aa27.1■■□□□ 1.93
ITGA3-215ENST00000515147 EP400Q96L91 3159 aa27.09■■□□□ 1.93
ITGA3-215ENST00000515147 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.09■■□□□ 1.93
ITGA3-215ENST00000515147 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.08■■□□□ 1.93
ITGA3-215ENST00000515147 FOXD1Q16676 465 aa27.07■■□□□ 1.92
ITGA3-215ENST00000515147 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.07■■□□□ 1.92
ITGA3-215ENST00000515147 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.07■■□□□ 1.92
ITGA3-215ENST00000515147 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
ITGA3-215ENST00000515147 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.06■■□□□ 1.92
ITGA3-215ENST00000515147 TECPR2O15040 1411 aa27.06■■□□□ 1.92
ITGA3-215ENST00000515147 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
ITGA3-215ENST00000515147 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.04■■□□□ 1.92
ITGA3-215ENST00000515147 FOXO3O43524 673 aa27.04■■□□□ 1.92
ITGA3-215ENST00000515147 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.02■■□□□ 1.92
ITGA3-215ENST00000515147 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.01■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 GLI3P10071 1580 aa27.01■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 NUTM2FA1L443 756 aa27■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.99■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.99■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 KIF1AQ12756 1690 aa26.98■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 STK26Q9P289 416 aa26.98■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 SLIT2O94813 1529 aa26.97■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 RGL3Q3MIN7 710 aa26.97■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 ABCC11Q96J66 1382 aa26.97■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 USP32Q8NFA0 1604 aa26.95■■□□□ 1.91
ITGA3-215ENST00000515147 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.95■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 PIK3C2GO75747 1445 aa26.94■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.94■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.93■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.93■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.93■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.93■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC125Q86Z20 511 aa26.92■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 ABCA3Q99758 1704 aa26.9■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.9■■□□□ 1.9
ITGA3-215ENST00000515147 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.89■■□□□ 1.89
ITGA3-215ENST00000515147 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.85■■□□□ 1.89
ITGA3-215ENST00000515147 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.85■■□□□ 1.89
ITGA3-215ENST00000515147 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
ITGA3-215ENST00000515147 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.83■■□□□ 1.89
ITGA3-215ENST00000515147 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.81■■□□□ 1.88
ITGA3-215ENST00000515147 SIRT1Q96EB6 747 aa26.81■■□□□ 1.88
ITGA3-215ENST00000515147 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.8■■□□□ 1.88
ITGA3-215ENST00000515147 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
ITGA3-215ENST00000515147 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.79■■□□□ 1.88
ITGA3-215ENST00000515147 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.77■■□□□ 1.88
ITGA3-215ENST00000515147 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.77■■□□□ 1.88
ITGA3-215ENST00000515147 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 VPS72Q15906 364 aa26.76■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 NRAPQ86VF7 1730 aa26.76■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 SBNO1A3KN83 1393 aa26.75■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.75■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 PLEKHG5O94827 1062 aa26.72■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 PSME1Q06323 249 aa26.72■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 ADGRB2O60241 1585 aa26.71■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 DLC1Q96QB1 1528 aa26.71■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 ALS2Q96Q42 1657 aa26.7■■□□□ 1.87
ITGA3-215ENST00000515147 PRAM1Q96QH2 718 aa26.7■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 ARHGEF10O15013 1369 aa26.7■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 LRP5O75197 1615 aa26.69■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.68■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 FAM83GA6ND36 823 aa26.68■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.68■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 ADGRB1O14514 1584 aa26.67■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.66■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.66■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.66■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.66■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ITGA3-215ENST00000515147 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ITGA3-215ENST00000515147 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ITGA3-215ENST00000515147 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.6■■□□□ 1.85
ITGA3-215ENST00000515147 POGKQ9P215 609 aa26.59■■□□□ 1.85
ITGA3-215ENST00000515147 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.59■■□□□ 1.85
ITGA3-215ENST00000515147 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ITGA3-215ENST00000515147 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.57■■□□□ 1.84
ITGA3-215ENST00000515147 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.57■■□□□ 1.84
ITGA3-215ENST00000515147 BTG4Q9NY30 223 aa26.57■■□□□ 1.84
ITGA3-215ENST00000515147 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
ITGA3-215ENST00000515147 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
ITGA3-215ENST00000515147 A0A0G2JS52 829 aa26.53■■□□□ 1.84
ITGA3-215ENST00000515147 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms