RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ORAI2Q96SN7 254 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHPRHQ149N8 1683 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAMC1P11047 1609 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POTEAQ6S8J7 498 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRP6O75581 1613 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRAM1Q96QH2 718 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DLC1Q96QB1 1528 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRB1O14514 1584 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUTM2FA1L443 756 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXO3O43524 673 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POGKQ9P215 609 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PXDNQ92626 1479 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AFF2P51816 1311 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C8orf37Q96NL8 207 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF1AQ12756 1690 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAMTS2O95450 1211 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RXRBP28702 533 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NGLY1Q96IV0 654 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSME1Q06323 249 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRB2O60241 1585 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SBNO1A3KN83 1393 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP21Q9UK80 565 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP32Q8NFA0 1604 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEUROD1Q13562 356 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF10O15013 1369 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDK19Q9BWU1 502 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATRNO75882 1429 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP7BP35670 1465 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGS12O14924 1447 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLIT2O94813 1529 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITSN1Q15811 1721 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACEP12821 1306 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALS2Q96Q42 1657 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHG5O94827 1062 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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