RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 PNPLA6Q8IY17 1366 aa33.47■■■□□ 2.95
ZBED3-203ENST00000511587 STK26Q9P289 416 aa33.47■■■□□ 2.95
ZBED3-203ENST00000511587 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
ZBED3-203ENST00000511587 HRCP23327 699 aa33.45■■■□□ 2.95
ZBED3-203ENST00000511587 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
ZBED3-203ENST00000511587 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa33.45■■■□□ 2.94
ZBED3-203ENST00000511587 WAPLQ7Z5K2 1190 aa33.44■■■□□ 2.94
ZBED3-203ENST00000511587 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
ZBED3-203ENST00000511587 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
ZBED3-203ENST00000511587 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
ZBED3-203ENST00000511587 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
ZBED3-203ENST00000511587 CFAP70Q5T0N1 1121 aa33.39■■■□□ 2.94
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
ZBED3-203ENST00000511587 SIRT1Q96EB6 747 aa33.38■■■□□ 2.93
ZBED3-203ENST00000511587 FMN2Q9NZ56 1722 aa33.38■■■□□ 2.93
ZBED3-203ENST00000511587 ADGRB1O14514 1584 aa33.34■■■□□ 2.93
ZBED3-203ENST00000511587 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
ZBED3-203ENST00000511587 PXDNQ92626 1479 aa33.33■■■□□ 2.93
ZBED3-203ENST00000511587 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
ZBED3-203ENST00000511587 ESCO1Q5FWF5 840 aa33.33■■■□□ 2.93
ZBED3-203ENST00000511587 DLC1Q96QB1 1528 aa33.31■■■□□ 2.92
ZBED3-203ENST00000511587 NPHP3Q7Z494 1330 aa33.3■■■□□ 2.92
ZBED3-203ENST00000511587 AFF2P51816 1311 aa33.29■■■□□ 2.92
ZBED3-203ENST00000511587 KIF1AQ12756 1690 aa33.26■■■□□ 2.92
ZBED3-203ENST00000511587 NUTM2FA1L443 756 aa33.26■■■□□ 2.91
ZBED3-203ENST00000511587 FOXO3O43524 673 aa33.23■■■□□ 2.91
ZBED3-203ENST00000511587 C8orf37Q96NL8 207 aa33.23■■■□□ 2.91
ZBED3-203ENST00000511587 PRAM1Q96QH2 718 aa33.22■■■□□ 2.91
ZBED3-203ENST00000511587 ADGRB2O60241 1585 aa33.21■■■□□ 2.91
ZBED3-203ENST00000511587 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
ZBED3-203ENST00000511587 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.21■■■□□ 2.91
ZBED3-203ENST00000511587 STAC3Q96MF2 364 aa33.21■■■□□ 2.91
ZBED3-203ENST00000511587 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
ZBED3-203ENST00000511587 RXRBP28702 533 aa33.19■■■□□ 2.9
ZBED3-203ENST00000511587 ADAMTS2O95450 1211 aa33.18■■■□□ 2.9
ZBED3-203ENST00000511587 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
ZBED3-203ENST00000511587 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.18■■■□□ 2.9
ZBED3-203ENST00000511587 USP32Q8NFA0 1604 aa33.15■■■□□ 2.9
ZBED3-203ENST00000511587 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP33.14■■■□□ 2.9
ZBED3-203ENST00000511587 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.89
ZBED3-203ENST00000511587 NGLY1Q96IV0 654 aa33.12■■■□□ 2.89
ZBED3-203ENST00000511587 POGKQ9P215 609 aa33.11■■■□□ 2.89
ZBED3-203ENST00000511587 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.11■■■□□ 2.89
ZBED3-203ENST00000511587 ANKARQ7Z5J8 1434 aa33.11■■■□□ 2.89
ZBED3-203ENST00000511587 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
ZBED3-203ENST00000511587 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.09■■■□□ 2.89
ZBED3-203ENST00000511587 PHF8Q9UPP1 1060 aa33.09■■■□□ 2.89
ZBED3-203ENST00000511587 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
ZBED3-203ENST00000511587 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
ZBED3-203ENST00000511587 RGS12O14924 1447 aa33.07■■■□□ 2.88
ZBED3-203ENST00000511587 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
ZBED3-203ENST00000511587 KRT28Q7Z3Y7 464 aa33.05■■■□□ 2.88
ZBED3-203ENST00000511587 USP21Q9UK80 565 aa33.04■■■□□ 2.88
ZBED3-203ENST00000511587 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.03■■■□□ 2.88
ZBED3-203ENST00000511587 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa33.03■■■□□ 2.88
ZBED3-203ENST00000511587 TULP4Q9NRJ4 1543 aa33.02■■■□□ 2.88
ZBED3-203ENST00000511587 ATRNO75882 1429 aa33.02■■■□□ 2.88
ZBED3-203ENST00000511587 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 BCL9LQ86UU0 1499 aa33■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 SBNO1A3KN83 1393 aa33■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 PRR36Q9H6K5 1346 aa32.98■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 PSME1Q06323 249 aa32.97■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 ABCA3Q99758 1704 aa32.96■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 WASLO00401 505 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
ZBED3-203ENST00000511587 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa32.94■■■□□ 2.86
ZBED3-203ENST00000511587 SLIT2O94813 1529 aa32.93■■■□□ 2.86
ZBED3-203ENST00000511587 ARHGEF10O15013 1369 aa32.91■■■□□ 2.86
ZBED3-203ENST00000511587 ALS2Q96Q42 1657 aa32.89■■■□□ 2.86
ZBED3-203ENST00000511587 ATP7BP35670 1465 aa32.89■■■□□ 2.86
ZBED3-203ENST00000511587 ITSN1Q15811 1721 aa32.88■■■□□ 2.85
ZBED3-203ENST00000511587 NBPF1Q3BBV0 1214 aa32.85■■■□□ 2.85
ZBED3-203ENST00000511587 CABLES1Q8TDN4 633 aa32.85■■■□□ 2.85
ZBED3-203ENST00000511587 PLCH1Q4KWH8 1693 aa32.83■■■□□ 2.85
ZBED3-203ENST00000511587 GPRASP1Q5JY77 1395 aa32.83■■■□□ 2.85
ZBED3-203ENST00000511587 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa32.82■■■□□ 2.84
ZBED3-203ENST00000511587 UNC5CLQ8IV45 518 aa32.82■■■□□ 2.84
ZBED3-203ENST00000511587 GLI3P10071 1580 aa32.81■■■□□ 2.84
ZBED3-203ENST00000511587 NWD2Q9ULI1 1742 aa32.81■■■□□ 2.84
ZBED3-203ENST00000511587 LMOD2Q6P5Q4 547 aa32.8■■■□□ 2.84
ZBED3-203ENST00000511587 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
ZBED3-203ENST00000511587 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa32.8■■■□□ 2.84
ZBED3-203ENST00000511587 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
ZBED3-203ENST00000511587 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
ZBED3-203ENST00000511587 RALGAPBQ86X10 1494 aa32.78■■■□□ 2.84
ZBED3-203ENST00000511587 ATAD2Q6PL18 1390 aa32.76■■■□□ 2.83
ZBED3-203ENST00000511587 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.76■■■□□ 2.83
ZBED3-203ENST00000511587 CDK19Q9BWU1 502 aa32.76■■■□□ 2.83
ZBED3-203ENST00000511587 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
ZBED3-203ENST00000511587 PLEKHG5O94827 1062 aa32.74■■■□□ 2.83
ZBED3-203ENST00000511587 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.74■■■□□ 2.83
ZBED3-203ENST00000511587 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa32.72■■■□□ 2.83
ZBED3-203ENST00000511587 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
ZBED3-203ENST00000511587 NRAPQ86VF7 1730 aa32.71■■■□□ 2.83
ZBED3-203ENST00000511587 QRICH2Q9H0J4 1663 aa32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms