RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 STK26Q9P289 416 aa24.41■■□□□ 1.5
ITGA3-211ENST00000508100 LAMC1P11047 1609 aa24.41■■□□□ 1.5
ITGA3-211ENST00000508100 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.4■■□□□ 1.5
ITGA3-211ENST00000508100 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.39■■□□□ 1.49
ITGA3-211ENST00000508100 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.38■■□□□ 1.49
ITGA3-211ENST00000508100 USP21Q9UK80 565 aa24.36■■□□□ 1.49
ITGA3-211ENST00000508100 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.35■■□□□ 1.49
ITGA3-211ENST00000508100 RGS12O14924 1447 aa24.35■■□□□ 1.49
ITGA3-211ENST00000508100 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.35■■□□□ 1.49
ITGA3-211ENST00000508100 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.34■■□□□ 1.49
ITGA3-211ENST00000508100 FOXO3O43524 673 aa24.34■■□□□ 1.49
ITGA3-211ENST00000508100 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
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ITGA3-211ENST00000508100 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
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ITGA3-211ENST00000508100 ABCC11Q96J66 1382 aa24.31■■□□□ 1.48
ITGA3-211ENST00000508100 TECPR2O15040 1411 aa24.31■■□□□ 1.48
ITGA3-211ENST00000508100 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
ITGA3-211ENST00000508100 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
ITGA3-211ENST00000508100 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ITGA3-211ENST00000508100 PIK3C2GO75747 1445 aa24.27■■□□□ 1.48
ITGA3-211ENST00000508100 IFT172Q9UG01 1749 aa24.27■■□□□ 1.48
ITGA3-211ENST00000508100 PXDNQ92626 1479 aa24.26■■□□□ 1.47
ITGA3-211ENST00000508100 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.26■■□□□ 1.47
ITGA3-211ENST00000508100 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ITGA3-211ENST00000508100 MYOM2P54296 1465 aa24.25■■□□□ 1.47
ITGA3-211ENST00000508100 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.24■■□□□ 1.47
ITGA3-211ENST00000508100 SIRT1Q96EB6 747 aa24.23■■□□□ 1.47
ITGA3-211ENST00000508100 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ITGA3-211ENST00000508100 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.23■■□□□ 1.47
ITGA3-211ENST00000508100 ATRNO75882 1429 aa24.22■■□□□ 1.47
ITGA3-211ENST00000508100 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.19■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.19■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.18■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.18■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.17■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 KIF1AQ12756 1690 aa24.16■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 PSME1Q06323 249 aa24.16■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.16■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ITGA3-211ENST00000508100 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
ITGA3-211ENST00000508100 PRAM1Q96QH2 718 aa24.14■■□□□ 1.45
ITGA3-211ENST00000508100 POGKQ9P215 609 aa24.14■■□□□ 1.45
ITGA3-211ENST00000508100 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.13■■□□□ 1.45
ITGA3-211ENST00000508100 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.12■■□□□ 1.45
ITGA3-211ENST00000508100 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.1■■□□□ 1.45
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC125Q86Z20 511 aa24.1■■□□□ 1.45
ITGA3-211ENST00000508100 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.09■■□□□ 1.45
ITGA3-211ENST00000508100 PLEKHG5O94827 1062 aa24.08■■□□□ 1.45
ITGA3-211ENST00000508100 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.08■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 SLIT2O94813 1529 aa24.06■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.06■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 SBNO1A3KN83 1393 aa24.05■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
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ITGA3-211ENST00000508100 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.04■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.04■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.04■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.04■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 DLC1Q96QB1 1528 aa24.04■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 ARHGEF10O15013 1369 aa24.03■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.02■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ITGA3-211ENST00000508100 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.01■■□□□ 1.43
ITGA3-211ENST00000508100 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
ITGA3-211ENST00000508100 GLI3P10071 1580 aa23.99■■□□□ 1.43
ITGA3-211ENST00000508100 VPS72Q15906 364 aa23.99■■□□□ 1.43
ITGA3-211ENST00000508100 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
ITGA3-211ENST00000508100 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
ITGA3-211ENST00000508100 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.98■■□□□ 1.43
ITGA3-211ENST00000508100 STAC3Q96MF2 364 aa23.98■■□□□ 1.43
ITGA3-211ENST00000508100 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.98■■□□□ 1.43
ITGA3-211ENST00000508100 ADGRB1O14514 1584 aa23.97■■□□□ 1.43
ITGA3-211ENST00000508100 ADGRB2O60241 1585 aa23.95■■□□□ 1.43
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ITGA3-211ENST00000508100 FAM83GA6ND36 823 aa23.94■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
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ITGA3-211ENST00000508100 EP400Q96L91 3159 aa23.92■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0G2JS52 829 aa23.92■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 MYT1Q01538 1121 aa23.92■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.92■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
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ITGA3-211ENST00000508100 ABCA3Q99758 1704 aa23.9■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.9■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.9■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.9■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.89■■□□□ 1.42
ITGA3-211ENST00000508100 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
ITGA3-211ENST00000508100 BTG4Q9NY30 223 aa23.89■■□□□ 1.41
ITGA3-211ENST00000508100 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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