RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.21■■■■□ 3.07
PITX1-206ENST00000507253 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.2■■■■□ 3.07
PITX1-206ENST00000507253 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.19■■■■□ 3.06
PITX1-206ENST00000507253 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.15■■■■□ 3.06
PITX1-206ENST00000507253 JCADQ9P266 1359 aa34.14■■■■□ 3.06
PITX1-206ENST00000507253 PRAM1Q96QH2 718 aa34.13■■■■□ 3.05
PITX1-206ENST00000507253 NEUROD1Q13562 356 aa34.12■■■■□ 3.05
PITX1-206ENST00000507253 POGKQ9P215 609 aa34.12■■■■□ 3.05
PITX1-206ENST00000507253 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.12■■■■□ 3.05
PITX1-206ENST00000507253 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.1■■■■□ 3.05
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PITX1-206ENST00000507253 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.04■■■■□ 3.042e-6■■■■□ 20
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PITX1-206ENST00000507253 NPHP3Q7Z494 1330 aa33.96■■■■□ 3.03
PITX1-206ENST00000507253 TONSLQ96HA7 1378 aa33.96■■■■□ 3.03
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PITX1-206ENST00000507253 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
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PITX1-206ENST00000507253 PXDNQ92626 1479 aa33.87■■■■□ 3.01
PITX1-206ENST00000507253 PNPLA6Q8IY17 1366 aa33.86■■■■□ 3.01
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PITX1-206ENST00000507253 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
PITX1-206ENST00000507253 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
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PITX1-206ENST00000507253 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
PITX1-206ENST00000507253 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
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