RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504092.5

CTBP1-205, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 5

Gene CTBP1, Length 920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-205	ENST00000504092	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
CTBP1-205	ENST00000504092	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		28.02	■■■□□ 2.08
CTBP1-205	ENST00000504092	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	LAMC1	P11047	1609 aa		28	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	IFT172	Q9UG01	1749 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	RGS12	O14924	1447 aa		27.95	■■■□□ 2.07
CTBP1-205	ENST00000504092	FOXO3	O43524	673 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CTBP1-205	ENST00000504092	USP21	Q9UK80	565 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CTBP1-205	ENST00000504092	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CTBP1-205	ENST00000504092	PIK3C2G	O75747	1445 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CTBP1-205	ENST00000504092	TECPR2	O15040	1411 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CTBP1-205	ENST00000504092	ABCC11	Q96J66	1382 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CTBP1-205	ENST00000504092	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CTBP1-205	ENST00000504092	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CTBP1-205	ENST00000504092	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
CTBP1-205	ENST00000504092	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CTBP1-205	ENST00000504092	PXDN	Q92626	1479 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CTBP1-205	ENST00000504092	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	27.85	■■■□□ 2.05
CTBP1-205	ENST00000504092	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CTBP1-205	ENST00000504092	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CTBP1-205	ENST00000504092	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTBP1-205	ENST00000504092	MYOM2	P54296	1465 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTBP1-205	ENST00000504092	PLEKHG5	O94827	1062 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTBP1-205	ENST00000504092	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	KIF1A	Q12756	1690 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	ATRN	O75882	1429 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	PRAM1	Q96QH2	718 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	POGK	Q9P215	609 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CTBP1-205	ENST00000504092	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CTBP1-205	ENST00000504092	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CTBP1-205	ENST00000504092	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CTBP1-205	ENST00000504092	SIRT1	Q96EB6	747 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CTBP1-205	ENST00000504092	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CTBP1-205	ENST00000504092	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CTBP1-205	ENST00000504092	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CTBP1-205	ENST00000504092	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CTBP1-205	ENST00000504092	PSME1	Q06323	249 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CTBP1-205	ENST00000504092	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CTBP1-205	ENST00000504092	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CTBP1-205	ENST00000504092	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CTBP1-205	ENST00000504092	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CTBP1-205	ENST00000504092	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CTBP1-205	ENST00000504092	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CTBP1-205	ENST00000504092	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CTBP1-205	ENST00000504092	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CTBP1-205	ENST00000504092	USP32	Q8NFA0	1604 aa		27.65	■■■□□ 2.02
CTBP1-205	ENST00000504092	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
CTBP1-205	ENST00000504092	DLC1	Q96QB1	1528 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CTBP1-205	ENST00000504092	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
CTBP1-205	ENST00000504092	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
CTBP1-205	ENST00000504092	SLIT2	O94813	1529 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CTBP1-205	ENST00000504092	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CTBP1-205	ENST00000504092	SBNO1	A3KN83	1393 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CTBP1-205	ENST00000504092	ADGRB1	O14514	1584 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CTBP1-205	ENST00000504092	ARHGEF10	O15013	1369 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CTBP1-205	ENST00000504092	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CTBP1-205	ENST00000504092	GLI3	P10071	1580 aa		27.57	■■■□□ 2
CTBP1-205	ENST00000504092	ADGRB2	O60241	1585 aa		27.56	■■■□□ 2
CTBP1-205	ENST00000504092	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
CTBP1-205	ENST00000504092	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		27.54	■■■□□ 2
CTBP1-205	ENST00000504092	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		27.54	■■■□□ 2
CTBP1-205	ENST00000504092	ABCA3	Q99758	1704 aa		27.53	■■■□□ 2
CTBP1-205	ENST00000504092		A0A0G2JS52	829 aa		27.53	■■■□□ 2
CTBP1-205	ENST00000504092	MYT1	Q01538	1121 aa		27.53	■■■□□ 2
CTBP1-205	ENST00000504092	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
CTBP1-205	ENST00000504092	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		27.52	■■■□□ 2
CTBP1-205	ENST00000504092	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	VPS72	Q15906	364 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	CCDC125	Q86Z20	511 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		27.49	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	FAM83G	A6ND36	823 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	EP400	Q96L91	3159 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	STAC3	Q96MF2	364 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
CTBP1-205	ENST00000504092	BTG4	Q9NY30	223 aa		27.44	■■□□□ 1.98
CTBP1-205	ENST00000504092	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
CTBP1-205	ENST00000504092	HRC	P23327	699 aa		27.43	■■□□□ 1.98
CTBP1-205	ENST00000504092	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
CTBP1-205	ENST00000504092	ALS2	Q96Q42	1657 aa		27.41	■■□□□ 1.98

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