RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498448.1

C1orf109-212, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf109, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-212ENST00000498448 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.05■■□□□ 1.76
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C1orf109-212ENST00000498448 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.02■■□□□ 1.76
C1orf109-212ENST00000498448 MST1RQ04912 1400 aa26.01■■□□□ 1.75
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C1orf109-212ENST00000498448 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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C1orf109-212ENST00000498448 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
C1orf109-212ENST00000498448 EVC2Q86UK5 1308 aa25.75■■□□□ 1.71
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C1orf109-212ENST00000498448 SLC24A1O60721 1099 aa25.73■■□□□ 1.71
C1orf109-212ENST00000498448 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.72■■□□□ 1.71
C1orf109-212ENST00000498448 KIF1AQ12756 1690 aa25.72■■□□□ 1.71
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C1orf109-212ENST00000498448 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.71■■□□□ 1.71
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C1orf109-212ENST00000498448 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.64■■□□□ 1.7
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C1orf109-212ENST00000498448 SBNO1A3KN83 1393 aa25.61■■□□□ 1.69
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C1orf109-212ENST00000498448 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
C1orf109-212ENST00000498448 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
C1orf109-212ENST00000498448 TESK2Q96S53 571 aa25.57■■□□□ 1.68
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C1orf109-212ENST00000498448 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
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C1orf109-212ENST00000498448 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.55■■□□□ 1.68
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C1orf109-212ENST00000498448 CDCA8Q53HL2 280 aa25.52■■□□□ 1.68
C1orf109-212ENST00000498448 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
C1orf109-212ENST00000498448 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
C1orf109-212ENST00000498448 LRP6O75581 1613 aa25.48■■□□□ 1.67
C1orf109-212ENST00000498448 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
C1orf109-212ENST00000498448 TMC1Q8TDI8 760 aa25.47■■□□□ 1.67
C1orf109-212ENST00000498448 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
C1orf109-212ENST00000498448 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.45■■□□□ 1.67
C1orf109-212ENST00000498448 ADAMTS2O95450 1211 aa25.44■■□□□ 1.66
C1orf109-212ENST00000498448 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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