RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 USP21Q9UK80 565 aa34.86■■■■□ 3.17
SIMC1-208ENST00000495423 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.85■■■■□ 3.17
SIMC1-208ENST00000495423 MYOM2P54296 1465 aa34.84■■■■□ 3.17
SIMC1-208ENST00000495423 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
SIMC1-208ENST00000495423 ATRNO75882 1429 aa34.83■■■■□ 3.17
SIMC1-208ENST00000495423 IFT172Q9UG01 1749 aa34.83■■■■□ 3.17
SIMC1-208ENST00000495423 PXDNQ92626 1479 aa34.83■■■■□ 3.17
SIMC1-208ENST00000495423 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
SIMC1-208ENST00000495423 EP400Q96L91 3159 aa34.81■■■■□ 3.16
SIMC1-208ENST00000495423 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.8■■■■□ 3.16
SIMC1-208ENST00000495423 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.79■■■■□ 3.16
SIMC1-208ENST00000495423 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.79■■■■□ 3.16
SIMC1-208ENST00000495423 TECPR2O15040 1411 aa34.77■■■■□ 3.16
SIMC1-208ENST00000495423 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
SIMC1-208ENST00000495423 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.75■■■■□ 3.15
SIMC1-208ENST00000495423 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.73■■■■□ 3.15
SIMC1-208ENST00000495423 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.72■■■■□ 3.15
SIMC1-208ENST00000495423 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.7■■■■□ 3.15
SIMC1-208ENST00000495423 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
SIMC1-208ENST00000495423 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.69■■■■□ 3.14
SIMC1-208ENST00000495423 KIF1AQ12756 1690 aa34.69■■■■□ 3.14
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.68■■■■□ 3.14
SIMC1-208ENST00000495423 FOXO3O43524 673 aa34.68■■■■□ 3.14
SIMC1-208ENST00000495423 ABCC11Q96J66 1382 aa34.65■■■■□ 3.14
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.65■■■■□ 3.14
SIMC1-208ENST00000495423 FOXD1Q16676 465 aa34.64■■■■□ 3.14
SIMC1-208ENST00000495423 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
SIMC1-208ENST00000495423 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
SIMC1-208ENST00000495423 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.62■■■■□ 3.13
SIMC1-208ENST00000495423 STK26Q9P289 416 aa34.61■■■■□ 3.13
SIMC1-208ENST00000495423 PIK3C2GO75747 1445 aa34.61■■■■□ 3.13
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC125Q86Z20 511 aa34.59■■■■□ 3.13
SIMC1-208ENST00000495423 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
SIMC1-208ENST00000495423 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.59■■■■□ 3.13
SIMC1-208ENST00000495423 GLI3P10071 1580 aa34.58■■■■□ 3.13
SIMC1-208ENST00000495423 USP32Q8NFA0 1604 aa34.58■■■■□ 3.13
SIMC1-208ENST00000495423 SLIT2O94813 1529 aa34.57■■■■□ 3.12
SIMC1-208ENST00000495423 RGL3Q3MIN7 710 aa34.57■■■■□ 3.12
SIMC1-208ENST00000495423 BRWD3Q6RI45 1802 aa34.57■■■■□ 3.12
SIMC1-208ENST00000495423 NUTM2FA1L443 756 aa34.56■■■■□ 3.12
SIMC1-208ENST00000495423 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.55■■■■□ 3.12
SIMC1-208ENST00000495423 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.54■■■■□ 3.12
SIMC1-208ENST00000495423 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.54■■■■□ 3.12
SIMC1-208ENST00000495423 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.52■■■■□ 3.12
SIMC1-208ENST00000495423 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.51■■■■□ 3.12
SIMC1-208ENST00000495423 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.5■■■■□ 3.11
SIMC1-208ENST00000495423 SIRT1Q96EB6 747 aa34.5■■■■□ 3.11
SIMC1-208ENST00000495423 ABCA3Q99758 1704 aa34.5■■■■□ 3.11
SIMC1-208ENST00000495423 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.49■■■■□ 3.11
SIMC1-208ENST00000495423 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.49■■■■□ 3.11
SIMC1-208ENST00000495423 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.46■■■■□ 3.11
SIMC1-208ENST00000495423 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.45■■■■□ 3.11
SIMC1-208ENST00000495423 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.45■■■■□ 3.11
SIMC1-208ENST00000495423 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
SIMC1-208ENST00000495423 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SIMC1-208ENST00000495423 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.39■■■■□ 3.1
SIMC1-208ENST00000495423 PSME1Q06323 249 aa34.37■■■■□ 3.09
SIMC1-208ENST00000495423 SBNO1A3KN83 1393 aa34.36■■■■□ 3.09
SIMC1-208ENST00000495423 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
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SIMC1-208ENST00000495423 DLC1Q96QB1 1528 aa34.34■■■■□ 3.09
SIMC1-208ENST00000495423 ADGRB2O60241 1585 aa34.33■■■■□ 3.09
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGEF10O15013 1369 aa34.32■■■■□ 3.08
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SIMC1-208ENST00000495423 NRAPQ86VF7 1730 aa34.31■■■■□ 3.08
SIMC1-208ENST00000495423 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
SIMC1-208ENST00000495423 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.31■■■■□ 3.08
SIMC1-208ENST00000495423 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.31■■■■□ 3.08
SIMC1-208ENST00000495423 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
SIMC1-208ENST00000495423 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.3■■■■□ 3.08
SIMC1-208ENST00000495423 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
SIMC1-208ENST00000495423 SEPT12Q8IYM1 358 aa34.3■■■■□ 3.08
SIMC1-208ENST00000495423 PRAM1Q96QH2 718 aa34.27■■■■□ 3.08
SIMC1-208ENST00000495423 ALS2Q96Q42 1657 aa34.27■■■■□ 3.08
SIMC1-208ENST00000495423 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.24■■■■□ 3.07
SIMC1-208ENST00000495423 ADGRB1O14514 1584 aa34.23■■■■□ 3.07
SIMC1-208ENST00000495423 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
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SIMC1-208ENST00000495423 LRP5O75197 1615 aa34.22■■■■□ 3.07
SIMC1-208ENST00000495423 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
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SIMC1-208ENST00000495423 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.2■■■■□ 3.07
SIMC1-208ENST00000495423 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.2■■■■□ 3.07
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SIMC1-208ENST00000495423 PLEKHG5O94827 1062 aa34.17■■■■□ 3.06
SIMC1-208ENST00000495423 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.17■■■■□ 3.06
SIMC1-208ENST00000495423 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.14■■■■□ 3.06
SIMC1-208ENST00000495423 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.13■■■■□ 3.05
SIMC1-208ENST00000495423 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
SIMC1-208ENST00000495423 ITSN1Q15811 1721 aa34.1■■■■□ 3.05
SIMC1-208ENST00000495423 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.1■■■■□ 3.05
SIMC1-208ENST00000495423 BTG4Q9NY30 223 aa34.09■■■■□ 3.05
SIMC1-208ENST00000495423 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.07■■■■□ 3.05
SIMC1-208ENST00000495423 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa34.07■■■■□ 3.04
SIMC1-208ENST00000495423 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
SIMC1-208ENST00000495423 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
SIMC1-208ENST00000495423 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.06■■■■□ 3.04
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