RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495220.5

ARRDC1-211, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARRDC1, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-211ENST00000495220 POGKQ9P215 609 aa28.68■■■□□ 2.18
ARRDC1-211ENST00000495220 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
ARRDC1-211ENST00000495220 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-211ENST00000495220 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-211ENST00000495220 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-211ENST00000495220 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-211ENST00000495220 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.65■■■□□ 2.18
ARRDC1-211ENST00000495220 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-211ENST00000495220 C14orf37Q86TY3 774 aa28.63■■■□□ 2.17
ARRDC1-211ENST00000495220 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-211ENST00000495220 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-211ENST00000495220 MSH6P52701 1360 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-211ENST00000495220 DCCP43146 1447 aa28.59■■■□□ 2.17
ARRDC1-211ENST00000495220 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-211ENST00000495220 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-211ENST00000495220 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-211ENST00000495220 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-211ENST00000495220 USP47Q96K76 1375 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-211ENST00000495220 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.55■■■□□ 2.16
ARRDC1-211ENST00000495220 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.54■■■□□ 2.16
ARRDC1-211ENST00000495220 SLC24A1O60721 1099 aa28.53■■■□□ 2.16
ARRDC1-211ENST00000495220 ATF3P18847 181 aa28.53■■■□□ 2.16
ARRDC1-211ENST00000495220 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
ARRDC1-211ENST00000495220 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
ARRDC1-211ENST00000495220 ADGRB2O60241 1585 aa28.52■■■□□ 2.16
ARRDC1-211ENST00000495220 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.52■■■□□ 2.16
ARRDC1-211ENST00000495220 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.51■■■□□ 2.15
ARRDC1-211ENST00000495220 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.51■■■□□ 2.15
ARRDC1-211ENST00000495220 SLAIN2Q9P270 581 aa28.49■■■□□ 2.15
ARRDC1-211ENST00000495220 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
ARRDC1-211ENST00000495220 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
ARRDC1-211ENST00000495220 TESK2Q96S53 571 aa28.45■■■□□ 2.14
ARRDC1-211ENST00000495220 EVC2Q86UK5 1308 aa28.43■■■□□ 2.14
ARRDC1-211ENST00000495220 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
ARRDC1-211ENST00000495220 MST1RQ04912 1400 aa28.42■■■□□ 2.14
ARRDC1-211ENST00000495220 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.41■■■□□ 2.14
ARRDC1-211ENST00000495220 CDK19Q9BWU1 502 aa28.41■■■□□ 2.14
ARRDC1-211ENST00000495220 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.41■■■□□ 2.14
ARRDC1-211ENST00000495220 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.39■■■□□ 2.14
ARRDC1-211ENST00000495220 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
ARRDC1-211ENST00000495220 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.38■■■□□ 2.13
ARRDC1-211ENST00000495220 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.37■■■□□ 2.13
ARRDC1-211ENST00000495220 TMF1P82094 1093 aa28.36■■■□□ 2.13
ARRDC1-211ENST00000495220 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
ARRDC1-211ENST00000495220 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ARRDC1-211ENST00000495220 NUTM2FA1L443 756 aa28.32■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 CDCA8Q53HL2 280 aa28.31■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 CABP2Q9NPB3 220 aa28.31■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.31■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.3■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 USP32Q8NFA0 1604 aa28.29■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 ATP7BP35670 1465 aa28.29■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 BRINP3Q76B58 766 aa28.29■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.28■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 JCADQ9P266 1359 aa28.28■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.28■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 ORAI2Q96SN7 254 aa28.28■■■□□ 2.12
ARRDC1-211ENST00000495220 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
ARRDC1-211ENST00000495220 ITSN1Q15811 1721 aa28.24■■■□□ 2.11
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ARRDC1-211ENST00000495220 PHLPP1O60346 1717 aa28.23■■■□□ 2.11
ARRDC1-211ENST00000495220 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.23■■■□□ 2.11
ARRDC1-211ENST00000495220 KIF1AQ12756 1690 aa28.21■■■□□ 2.11
ARRDC1-211ENST00000495220 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.21■■■□□ 2.11
ARRDC1-211ENST00000495220 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.19■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 CABP1Q9NZU7 370 aa28.18■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.18■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.18■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 POTEAQ6S8J7 498 aa28.17■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.17■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.17■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 FOXO3O43524 673 aa28.15■■■□□ 2.1
ARRDC1-211ENST00000495220 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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ARRDC1-211ENST00000495220 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.13■■■□□ 2.09
ARRDC1-211ENST00000495220 ACEP12821 1306 aa28.13■■■□□ 2.09
ARRDC1-211ENST00000495220 PSME1Q06323 249 aa28.11■■■□□ 2.09
ARRDC1-211ENST00000495220 TMC1Q8TDI8 760 aa28.11■■■□□ 2.09
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
ARRDC1-211ENST00000495220 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.11■■■□□ 2.09
ARRDC1-211ENST00000495220 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
ARRDC1-211ENST00000495220 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.1■■■□□ 2.09
ARRDC1-211ENST00000495220 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.09■■■□□ 2.09
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ARRDC1-211ENST00000495220 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.08■■■□□ 2.09
ARRDC1-211ENST00000495220 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
ARRDC1-211ENST00000495220 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 CCDC7Q96M83 1385 aa28.06■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 PXDNQ92626 1479 aa28.06■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.05■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.04■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.04■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 SBNO1A3KN83 1393 aa28.03■■■□□ 2.08
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